53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3395 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  723    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  82.57 
 
 		 319 aa  477  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  94.02 
 
 		 340 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  95.83 
 
 		 350 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  82.43 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  84.55 
 
 		 312 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  79.04 
 
 		 290 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  85.12 
 
 		 402 aa  362  7.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  79.19 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  75.22 
 
 		 289 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  60.75 
 
 		 345 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  75.82 
 
 		 314 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  75.42 
 
 		 314 aa  338  9e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  81.17 
 
 		 310 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  75.54 
 
 		 321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  55.37 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  50.81 
 
 		 257 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  51.83 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  53.24 
 
 		 302 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  49.62 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  50 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  52.35 
 
 		 160 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  44.72 
 
 		 249 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  32.98 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  43.21 
 
 		 108 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  29.59 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  32 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  34.03 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  32.93 
 
 		 225 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  38.24 
 
 		 602 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  41.86 
 
 		 235 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  31.16 
 
 		 2196 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  41.86 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  30.95 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  31.16 
 
 		 244 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  29.77 
 
 		 284 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  37.78 
 
 		 200 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  28 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  34.91 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.26 
 
 		 491 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  30.94 
 
 		 2906 aa  47  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  41.84 
 
 		 925 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  39.55 
 
 		 2400 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  40.22 
 
 		 189 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2227  hypothetical protein  36.07 
 
 		 241 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  37.04 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  29.35 
 
 		 230 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  26.04 
 
 		 236 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  27.32 
 
 		 250 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  27.32 
 
 		 250 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  35.77 
 
 		 201 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>