99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2196 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  87.7 
 
 
244 aa  414  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  91.74 
 
 
230 aa  414  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  82.95 
 
 
258 aa  411  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  77.73 
 
 
222 aa  345  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  71.32 
 
 
259 aa  343  8e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  75.42 
 
 
245 aa  278  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  71.04 
 
 
245 aa  266  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  71.04 
 
 
259 aa  266  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  70.49 
 
 
245 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  61.08 
 
 
217 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  56.31 
 
 
229 aa  265  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  61.08 
 
 
217 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  58.45 
 
 
230 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  59.05 
 
 
239 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  58.59 
 
 
229 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  70.65 
 
 
259 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  57.99 
 
 
229 aa  260  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  64.5 
 
 
200 aa  260  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  66.1 
 
 
248 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  67.57 
 
 
265 aa  258  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  66.1 
 
 
248 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  54.51 
 
 
243 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  60.87 
 
 
218 aa  254  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  56.56 
 
 
232 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  58.46 
 
 
260 aa  241  6e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  55.76 
 
 
227 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  55.28 
 
 
250 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  55.28 
 
 
250 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  54.35 
 
 
232 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  33.92 
 
 
225 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  32.51 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3700  hypothetical protein  55.06 
 
 
114 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  33.64 
 
 
238 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  32.86 
 
 
226 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  34.27 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  35.62 
 
 
274 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  36.31 
 
 
254 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  30.47 
 
 
231 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  31.12 
 
 
243 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  31.12 
 
 
243 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  33.49 
 
 
222 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  31.22 
 
 
240 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  30.13 
 
 
259 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  30.24 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  33.52 
 
 
226 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  30.24 
 
 
252 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  31.67 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  32.69 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  27.23 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  30.15 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  32.16 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  29.06 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  32.94 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  27.05 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  32.35 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  28.31 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  31.36 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  25.21 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
255 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  28.98 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  26.22 
 
 
254 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0800  protein of unknown function DUF820  30.53 
 
 
238 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  28.41 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  26.8 
 
 
281 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  30.51 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  29.71 
 
 
259 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  29.21 
 
 
260 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  27.14 
 
 
248 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  29.67 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  32.35 
 
 
241 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  32.28 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  24.42 
 
 
235 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  44.23 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  47.92 
 
 
195 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  44.44 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  26.71 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  75.86 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  36.67 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  31.51 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  48.98 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  31.25 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  32.47 
 
 
153 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2988  hypothetical protein  24.79 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00225611  normal  0.747663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  32.09 
 
 
254 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  32.39 
 
 
190 aa  42.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  33.85 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  30.3 
 
 
302 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  31.65 
 
 
191 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  26.58 
 
 
181 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  40.35 
 
 
182 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  28.12 
 
 
187 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  34.33 
 
 
241 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2886  hypothetical protein  27.48 
 
 
190 aa  41.6  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0379  protein of unknown function DUF820  51.16 
 
 
256 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1443  hypothetical protein  30.53 
 
 
224 aa  41.6  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>