89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4440 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4440  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0116829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4444  hypothetical protein  97.22 
 
 		 334 aa  424  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0323466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4445  hypothetical protein  95.81 
 
 		 298 aa  420  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.434289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4442  hypothetical protein  93.57 
 
 		 243 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4443  hypothetical protein  94.91 
 
 		 264 aa  410  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000339677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4441  hypothetical protein  82.52 
 
 		 285 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000651212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  79.45 
 
 		 254 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  78.08 
 
 		 261 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  71.43 
 
 		 287 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  50.78 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1443  hypothetical protein  36.09 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  34.15 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  33.9 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0800  protein of unknown function DUF820  32.92 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4546  protein of unknown function DUF820  33.47 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2988  hypothetical protein  29.73 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00225611  normal  0.747663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3073  hypothetical protein  34.33 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3884  hypothetical protein  33.6 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3834  hypothetical protein  33.2 
 
 		 265 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  34.55 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  34.69 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  34.69 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0388  protein of unknown function DUF820  28.1 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1484  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000078309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3529  protein of unknown function DUF820  29.58 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0379  protein of unknown function DUF820  27.69 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  29.54 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  29.84 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  32.99 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1441  protein of unknown function DUF820  27.6 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  28.1 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1412  protein of unknown function DUF820  27.6 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  29.48 
 
 		 237 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  29.07 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  29.18 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0157  protein of unknown function DUF820  27.59 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000154086  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0388  hypothetical protein  29.69 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0161  protein of unknown function DUF820  27.59 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  31.82 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  31.02 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  30 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  33.68 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2199  protein of unknown function DUF820  25.5 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000553062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  25.56 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2588  protein of unknown function DUF820  30 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  30.85 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  36.96 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1193  hypothetical protein  45.45 
 
 		 60 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  27.84 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  31.12 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  31.12 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1298  hypothetical protein  31.65 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  36.87 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  34.31 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  37.17 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  29.84 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  34.25 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  30.2 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  35.71 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  35.71 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  34.5 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  25.76 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  25.76 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1876  hypothetical protein  60 
 
 		 48 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  26.42 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  31.65 
 
 		 274 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  27.5 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  30.06 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  26.32 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  28.49 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  31.21 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1377  protein of unknown function DUF820  25.89 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  31.85 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  31.21 
 
 		 217 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  24.69 
 
 		 284 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  28.93 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  35.14 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  26.86 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0580  protein of unknown function DUF820  27.6 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  30.82 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  26.32 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0721  protein of unknown function DUF820  30.56 
 
 		 254 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00402744  normal  0.197954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  29.82 
 
 		 243 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>