56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3486 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  661    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  86.02 
 
 		 319 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  94.29 
 
 		 376 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  97.03 
 
 		 350 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  82.7 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  80.26 
 
 		 290 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  84.12 
 
 		 312 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  86.51 
 
 		 402 aa  363  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  77.16 
 
 		 289 aa  362  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  79.64 
 
 		 343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  65.42 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  77.37 
 
 		 314 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  80.17 
 
 		 310 aa  338  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  81.4 
 
 		 314 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  78.02 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  54.55 
 
 		 333 aa  255  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  51.41 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  49.81 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  50.44 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  50.2 
 
 		 319 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  53.24 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  51.74 
 
 		 330 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  52.38 
 
 		 160 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  44.22 
 
 		 249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  33.22 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  43.21 
 
 		 108 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  41.86 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  32.39 
 
 		 258 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  41.86 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  30.17 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  45.36 
 
 		 894 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  30.68 
 
 		 251 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  41.86 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  32.21 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  27.47 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  35.14 
 
 		 2196 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  24.4 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  33.01 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  29.26 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  34.91 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  29.26 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  37.78 
 
 		 200 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  31.9 
 
 		 1477 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  36.36 
 
 		 245 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  28.87 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  25.93 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  34.36 
 
 		 201 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  25.45 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  28 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  32.84 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  30.64 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  34.91 
 
 		 2906 aa  43.9  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  27.08 
 
 		 236 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  31.54 
 
 		 237 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  40 
 
 		 189 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>