39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3746 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  623  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  95.04 
 
 		 314 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  93.39 
 
 		 345 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  76.09 
 
 		 319 aa  407  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  75.48 
 
 		 340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  78.72 
 
 		 350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  75.41 
 
 		 376 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  73.01 
 
 		 290 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  72.2 
 
 		 339 aa  327  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  74.89 
 
 		 314 aa  315  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  75.45 
 
 		 343 aa  308  9e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  77.1 
 
 		 402 aa  306  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  74.35 
 
 		 312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  77.31 
 
 		 310 aa  302  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  51.45 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  50.59 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  49.62 
 
 		 257 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  50.21 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  49.78 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  48.85 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  49.79 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  44.22 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  36.07 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  36.59 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  26.87 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  41.57 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  31.98 
 
 		 258 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  29.8 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  22.88 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  29.05 
 
 		 256 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  35.48 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  30.17 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  40.32 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  23.56 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  24.66 
 
 		 230 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  29.89 
 
 		 217 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3115  protein of unknown function DUF820  32.91 
 
 		 208 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0751383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  28.45 
 
 		 187 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>