40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2241 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  665    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  95.87 
 
 
314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  93.48 
 
 
321 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  73.65 
 
 
319 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  76.09 
 
 
289 aa  363  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  75.4 
 
 
340 aa  355  5.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  77.87 
 
 
350 aa  347  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  75.52 
 
 
376 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  73.45 
 
 
290 aa  337  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  73.73 
 
 
339 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  75.32 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  74.35 
 
 
312 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  75 
 
 
343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  76.64 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  74.03 
 
 
310 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  48.96 
 
 
333 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  48.61 
 
 
332 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  51.75 
 
 
257 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  48.47 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  48.61 
 
 
300 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  48.07 
 
 
330 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  44.51 
 
 
319 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  49.31 
 
 
160 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  42.72 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  32.67 
 
 
251 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  32.79 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  41.57 
 
 
108 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  24.29 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  29.05 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 
222 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  33.85 
 
 
718 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  31.82 
 
 
245 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4520  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25 
 
 
1393 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398997  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  30.65 
 
 
2906 aa  43.9  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1632  hypothetical protein  39.81 
 
 
846 aa  43.5  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.790758 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  24.66 
 
 
2196 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2227  hypothetical protein  41.98 
 
 
241 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49618  predicted protein  39.58 
 
 
958 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  30.43 
 
 
258 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  38.71 
 
 
205 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>