50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0728 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  77.52 
 
 		 319 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  67.98 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  82.67 
 
 		 350 aa  362  7.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  82.27 
 
 		 339 aa  356  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  83.73 
 
 		 290 aa  354  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  81.31 
 
 		 312 aa  345  8e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  81.78 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  74.65 
 
 		 289 aa  331  9e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  74.34 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  64.22 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  78.97 
 
 		 314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  74.22 
 
 		 314 aa  312  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  76.06 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  51.6 
 
 		 257 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  52.63 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  51.35 
 
 		 302 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  48.31 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  48.31 
 
 		 332 aa  209  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  48.09 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  46.7 
 
 		 249 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  53.47 
 
 		 160 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  32.59 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  31.56 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  32.57 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  43.28 
 
 		 108 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1588  hypothetical protein  26.03 
 
 		 194 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.856601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  40 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  30.84 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  30.41 
 
 		 225 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  36.52 
 
 		 235 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  36.52 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  33.03 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  29.09 
 
 		 237 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  26.83 
 
 		 284 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  30.07 
 
 		 188 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  28.81 
 
 		 200 aa  46.2  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1632  hypothetical protein  47.42 
 
 		 846 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.790758 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  52.38 
 
 		 901 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  42.86 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  28.51 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  47.83 
 
 		 203 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  47.83 
 
 		 203 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  47.83 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  47.83 
 
 		 218 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  31.78 
 
 		 2906 aa  44.3  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  24.36 
 
 		 259 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  38.81 
 
 		 186 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  45.65 
 
 		 894 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>