156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0294 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2361  hypothetical protein  58.95 
 
 
191 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  51.34 
 
 
190 aa  193  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  51.93 
 
 
191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  46.52 
 
 
196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3807  protein of unknown function DUF820  48.31 
 
 
189 aa  177  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0961  protein of unknown function DUF820  46.24 
 
 
190 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0988  protein of unknown function DUF820  46.24 
 
 
188 aa  174  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3808  protein of unknown function DUF820  47.16 
 
 
187 aa  171  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5334  protein of unknown function DUF820  46.89 
 
 
195 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.510489  normal  0.17641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  47.62 
 
 
209 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  47.49 
 
 
189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4826  hypothetical protein  45.2 
 
 
193 aa  165  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0786797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3054  protein of unknown function DUF820  44.09 
 
 
189 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1588  hypothetical protein  44.12 
 
 
194 aa  160  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.856601  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  38.86 
 
 
189 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  38.86 
 
 
189 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  43.6 
 
 
217 aa  158  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  43.26 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  38.64 
 
 
198 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4343  protein of unknown function DUF820  41.94 
 
 
190 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2432  hypothetical protein  42.37 
 
 
202 aa  144  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal  0.365453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4405  protein of unknown function DUF820  41.94 
 
 
190 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738575  hitchhiker  0.000905365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  37.02 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  40.54 
 
 
186 aa  137  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3545  protein of unknown function DUF820  39.11 
 
 
194 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2319  protein of unknown function DUF820  36.21 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2268  protein of unknown function DUF820  36.21 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  37.57 
 
 
193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2551  protein of unknown function DUF820  38.98 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2079  hypothetical protein  35.26 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204058  hitchhiker  0.000474177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2885  hypothetical protein  39.31 
 
 
190 aa  124  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142642  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1860  hypothetical protein  38.55 
 
 
184 aa  124  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.571985  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2595  hypothetical protein  35.29 
 
 
230 aa  124  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0392428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5140  protein of unknown function DUF820  39.89 
 
 
200 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  41.85 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3395  protein of unknown function DUF820  34.04 
 
 
191 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2718  protein of unknown function DUF820  34.04 
 
 
191 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.602399  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1626  protein of unknown function DUF820  35.11 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1601  protein of unknown function DUF820  35.11 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0390  protein of unknown function DUF820  36.6 
 
 
209 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0036  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000477397  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2565  protein of unknown function DUF820  35.48 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3386  protein of unknown function DUF820  32.96 
 
 
194 aa  111  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127932  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1442  hypothetical protein  35.11 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2541  protein of unknown function DUF820  34.27 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1286  protein of unknown function DUF820  32.4 
 
 
193 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1255  protein of unknown function DUF820  32.4 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2886  hypothetical protein  34.1 
 
 
190 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  34.46 
 
 
187 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2266  protein of unknown function DUF820  33.15 
 
 
195 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0466597  hitchhiker  0.000108655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1422  hypothetical protein  39.5 
 
 
129 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0659527  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3475  protein of unknown function DUF820  32.61 
 
 
193 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2628  protein of unknown function DUF820  32.61 
 
 
193 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0573  protein of unknown function DUF820  31.91 
 
 
196 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4337  protein of unknown function DUF820  32.97 
 
 
195 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0248  protein of unknown function DUF820  32.61 
 
 
187 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4909  protein of unknown function DUF820  33.52 
 
 
192 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  29.94 
 
 
193 aa  97.8  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3717  hypothetical protein  31.21 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.0468458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3157  protein of unknown function DUF820  29.03 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1751  protein of unknown function DUF820  33.89 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3945  protein of unknown function DUF820  29.61 
 
 
195 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000129802  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3895  protein of unknown function DUF820  29.61 
 
 
195 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1727  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  33.56 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4290  protein of unknown function DUF820  31.35 
 
 
195 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3925  hypothetical protein  34.08 
 
 
188 aa  91.7  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.948868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  34.51 
 
 
206 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4350  protein of unknown function DUF820  31.35 
 
 
195 aa  91.3  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0173  protein of unknown function DUF820  31.49 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2001  protein of unknown function DUF820  33.15 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5107  protein of unknown function DUF820  35.26 
 
 
188 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.604393  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4644  hypothetical protein  35.26 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  31.84 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5185  protein of unknown function DUF820  32.2 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  31.46 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0741  protein of unknown function DUF820  28.8 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  31.68 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  35.67 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3531  hypothetical protein  30.9 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151198  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0563  hypothetical protein  33.68 
 
 
109 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  30.82 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1854  hypothetical protein  48 
 
 
89 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.951657  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  30.29 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  30.85 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1810  hypothetical protein  35.07 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00248062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  26.4 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  26.92 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  32.19 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  32.06 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  27.56 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  26.92 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5199  hypothetical protein  25.91 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  25.29 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2041  hypothetical protein  27.91 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  29.41 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  27.21 
 
 
191 aa  61.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  24.43 
 
 
187 aa  61.2  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>