103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2886 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2886  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0036  hypothetical protein  46.51 
 
 
192 aa  162  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000477397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2885  hypothetical protein  37.21 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142642  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5140  protein of unknown function DUF820  35.03 
 
 
200 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1255  protein of unknown function DUF820  37.14 
 
 
193 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3807  protein of unknown function DUF820  38.37 
 
 
189 aa  124  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1727  protein of unknown function DUF820  36.11 
 
 
191 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2628  protein of unknown function DUF820  36.21 
 
 
193 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3475  protein of unknown function DUF820  36.21 
 
 
193 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1286  protein of unknown function DUF820  36.57 
 
 
193 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1442  hypothetical protein  34.68 
 
 
197 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  36.05 
 
 
193 aa  122  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1751  protein of unknown function DUF820  36.11 
 
 
191 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2551  protein of unknown function DUF820  38.24 
 
 
190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2718  protein of unknown function DUF820  34.5 
 
 
191 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.602399  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1601  protein of unknown function DUF820  31.61 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3395  protein of unknown function DUF820  34.5 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1626  protein of unknown function DUF820  31.61 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4343  protein of unknown function DUF820  33.93 
 
 
190 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4405  protein of unknown function DUF820  33.93 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738575  hitchhiker  0.000905365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4337  protein of unknown function DUF820  32.39 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0988  protein of unknown function DUF820  36.84 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3925  hypothetical protein  34.25 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.948868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2266  protein of unknown function DUF820  30.81 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0466597  hitchhiker  0.000108655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0961  protein of unknown function DUF820  36.26 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4826  hypothetical protein  34.48 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0786797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  34.88 
 
 
190 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  35.43 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3808  protein of unknown function DUF820  36.05 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0573  protein of unknown function DUF820  32.58 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0390  protein of unknown function DUF820  32.77 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0741  protein of unknown function DUF820  34.48 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  34.68 
 
 
194 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  34.1 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5334  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
195 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.510489  normal  0.17641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1588  hypothetical protein  35.06 
 
 
194 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.856601  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2268  protein of unknown function DUF820  32.95 
 
 
189 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4909  protein of unknown function DUF820  32.93 
 
 
192 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2319  protein of unknown function DUF820  32.95 
 
 
189 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3717  hypothetical protein  35.71 
 
 
197 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.0468458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  36.52 
 
 
189 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  29.83 
 
 
209 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4350  protein of unknown function DUF820  30.68 
 
 
195 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3545  protein of unknown function DUF820  34.3 
 
 
194 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  36.02 
 
 
189 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3386  protein of unknown function DUF820  32.78 
 
 
194 aa  101  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127932  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4290  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 
195 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  32.75 
 
 
217 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3054  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
189 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  31.21 
 
 
189 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  31.21 
 
 
189 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3895  protein of unknown function DUF820  27.12 
 
 
195 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3945  protein of unknown function DUF820  27.12 
 
 
195 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000129802  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2432  hypothetical protein  32.16 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal  0.365453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3157  protein of unknown function DUF820  28.16 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  34.3 
 
 
198 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  31.79 
 
 
191 aa  97.8  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0248  protein of unknown function DUF820  32.56 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2361  hypothetical protein  31.67 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  34.83 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2079  hypothetical protein  29.78 
 
 
218 aa  94.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204058  hitchhiker  0.000474177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2595  hypothetical protein  27.49 
 
 
230 aa  90.5  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0392428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2541  protein of unknown function DUF820  29.48 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  28.33 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2565  protein of unknown function DUF820  29.73 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1860  hypothetical protein  29.14 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.571985  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  27.81 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1422  hypothetical protein  37.78 
 
 
129 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0659527  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  27.11 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0173  protein of unknown function DUF820  26.74 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  25.71 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  31.61 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4308  protein of unknown function DUF820  28.33 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  29.21 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2001  protein of unknown function DUF820  31.48 
 
 
188 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4968  protein of unknown function DUF820  28.45 
 
 
206 aa  61.6  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000167718  unclonable  0.00000000000000331839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2041  hypothetical protein  31.48 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  30.56 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  32.41 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5199  hypothetical protein  28 
 
 
234 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1810  hypothetical protein  29.63 
 
 
187 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00248062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  26.47 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  24.71 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0563  hypothetical protein  28.43 
 
 
109 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  28.3 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  28.3 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3531  hypothetical protein  26.01 
 
 
183 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151198  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5107  protein of unknown function DUF820  30.19 
 
 
188 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.604393  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4644  hypothetical protein  26.14 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  25.33 
 
 
257 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  26.67 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5185  protein of unknown function DUF820  27.36 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  27.36 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  22.22 
 
 
195 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  35.96 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  27.07 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  26.96 
 
 
192 aa  41.6  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  23.53 
 
 
202 aa  41.6  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  27.78 
 
 
230 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  27.48 
 
 
217 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>