128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3531 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3531  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  367  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151198  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4644  hypothetical protein  63.43 
 
 
188 aa  225  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5107  protein of unknown function DUF820  63.43 
 
 
188 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.604393  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5185  protein of unknown function DUF820  62.86 
 
 
188 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2361  hypothetical protein  34.44 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3807  protein of unknown function DUF820  35.81 
 
 
189 aa  87  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
190 aa  84.7  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  32.62 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  32.02 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  30.9 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  32.39 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3054  protein of unknown function DUF820  36.81 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  26.37 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2079  hypothetical protein  25.81 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204058  hitchhiker  0.000474177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  28.33 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3808  protein of unknown function DUF820  32 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  37.32 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0036  hypothetical protein  27.62 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000477397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  28.16 
 
 
194 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  30.94 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2268  protein of unknown function DUF820  22.73 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  30.22 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2319  protein of unknown function DUF820  22.73 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  29.61 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  28.77 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1860  hypothetical protein  27.84 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.571985  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1442  hypothetical protein  25.27 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4826  hypothetical protein  22.91 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0786797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0961  protein of unknown function DUF820  27.03 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0988  protein of unknown function DUF820  26.35 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28586 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  31.47 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2001  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  30.98 
 
 
188 aa  62  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3717  hypothetical protein  27.84 
 
 
197 aa  61.6  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.0468458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1255  protein of unknown function DUF820  25.27 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4337  protein of unknown function DUF820  25.33 
 
 
195 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1286  protein of unknown function DUF820  25.82 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1810  hypothetical protein  31.87 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00248062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  22.4 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5334  protein of unknown function DUF820  25.68 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.510489  normal  0.17641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  25.41 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  31.52 
 
 
188 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2432  hypothetical protein  24.58 
 
 
202 aa  58.5  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal  0.365453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  30.34 
 
 
186 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4405  protein of unknown function DUF820  27.56 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738575  hitchhiker  0.000905365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2565  protein of unknown function DUF820  26 
 
 
194 aa  58.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4343  protein of unknown function DUF820  27.56 
 
 
190 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  32.06 
 
 
194 aa  57.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  34.53 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  26.23 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2595  hypothetical protein  24.68 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0392428 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  26.84 
 
 
251 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  26.63 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  22.4 
 
 
244 aa  55.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  29.93 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  25.17 
 
 
257 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  35.04 
 
 
191 aa  55.1  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4308  protein of unknown function DUF820  28.06 
 
 
184 aa  55.1  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0173  protein of unknown function DUF820  24 
 
 
209 aa  54.7  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  31.87 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  32 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  24.44 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5199  hypothetical protein  30 
 
 
234 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0248  protein of unknown function DUF820  26.92 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  26.17 
 
 
193 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  23.94 
 
 
245 aa  52.4  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2886  hypothetical protein  26.01 
 
 
190 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3386  protein of unknown function DUF820  22.73 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127932  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1588  hypothetical protein  25.36 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.856601  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  24.81 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2885  hypothetical protein  25.53 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142642  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  28.1 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3475  protein of unknown function DUF820  20.65 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  23.03 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2628  protein of unknown function DUF820  20.65 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4366  protein of unknown function DUF820  28.67 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  34.07 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4968  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000167718  unclonable  0.00000000000000331839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2541  protein of unknown function DUF820  24.46 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  27.78 
 
 
192 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  25.77 
 
 
223 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3157  protein of unknown function DUF820  22.82 
 
 
191 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  27.45 
 
 
207 aa  48.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2551  protein of unknown function DUF820  23.33 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  35.26 
 
 
186 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3925  hypothetical protein  23.43 
 
 
188 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.948868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2041  hypothetical protein  29.21 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  29.5 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  24.04 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2266  protein of unknown function DUF820  19.44 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0466597  hitchhiker  0.000108655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0390  protein of unknown function DUF820  23.24 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0734  protein of unknown function DUF820  30.36 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1601  protein of unknown function DUF820  24.02 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3545  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1626  protein of unknown function DUF820  24.02 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>