131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4644 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4644  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5107  protein of unknown function DUF820  99.47 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.604393  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5185  protein of unknown function DUF820  88.83 
 
 		 188 aa  347  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3531  hypothetical protein  63.43 
 
 		 183 aa  225  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2361  hypothetical protein  34.97 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3807  protein of unknown function DUF820  35.29 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  33.71 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3054  protein of unknown function DUF820  34.05 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  36.46 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1860  hypothetical protein  35.33 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.571985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  34.62 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  38.97 
 
 		 191 aa  87.8  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  35.26 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  33.54 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  33.91 
 
 		 198 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  34.25 
 
 		 196 aa  84.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3808  protein of unknown function DUF820  35.39 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  32 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  31.43 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  37.58 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1810  hypothetical protein  37.35 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00248062 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3717  hypothetical protein  34.46 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.0468458 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0173  protein of unknown function DUF820  29.78 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  35.97 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  26.88 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0036  hypothetical protein  29.53 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000477397  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  28.67 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  28.67 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  27.93 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  35.91 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2001  protein of unknown function DUF820  33.71 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2268  protein of unknown function DUF820  23.43 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2319  protein of unknown function DUF820  23.43 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2595  hypothetical protein  31.01 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0392428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  31.84 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4343  protein of unknown function DUF820  28.26 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0961  protein of unknown function DUF820  32.41 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  31.28 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4405  protein of unknown function DUF820  27.72 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738575  hitchhiker  0.000905365 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0988  protein of unknown function DUF820  31.72 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  28.33 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  29.28 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  34.64 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  35.71 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2079  hypothetical protein  24.56 
 
 		 218 aa  67.8  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204058  hitchhiker  0.000474177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4337  protein of unknown function DUF820  27.43 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1442  hypothetical protein  28.16 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4826  hypothetical protein  25.71 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0786797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  36.84 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0248  protein of unknown function DUF820  28.09 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5334  protein of unknown function DUF820  30.67 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.510489  normal  0.17641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  28.12 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1255  protein of unknown function DUF820  25.81 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3545  protein of unknown function DUF820  29.94 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3157  protein of unknown function DUF820  28.77 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2541  protein of unknown function DUF820  30.5 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  28.19 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1286  protein of unknown function DUF820  26.84 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2628  protein of unknown function DUF820  27.46 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2266  protein of unknown function DUF820  28.47 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0466597  hitchhiker  0.000108655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3475  protein of unknown function DUF820  27.46 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3925  hypothetical protein  27.72 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.948868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  32.04 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  25.53 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2565  protein of unknown function DUF820  25.75 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  28.21 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2432  hypothetical protein  33.12 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal  0.365453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2885  hypothetical protein  31.16 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142642  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5199  hypothetical protein  34.93 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  27.07 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2041  hypothetical protein  31.94 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  34.06 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  24.32 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  29.25 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0741  protein of unknown function DUF820  26.26 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3386  protein of unknown function DUF820  25.82 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4308  protein of unknown function DUF820  29.77 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  24.06 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  28.87 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  31.25 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1588  hypothetical protein  25.81 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.856601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  23.67 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2886  hypothetical protein  26.14 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1727  protein of unknown function DUF820  25.67 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0390  protein of unknown function DUF820  27.62 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1422  hypothetical protein  30.1 
 
 		 129 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0659527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  28.16 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  24.46 
 
 		 257 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4909  protein of unknown function DUF820  28.17 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1751  protein of unknown function DUF820  25 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4541  protein of unknown function DUF820  28.97 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1601  protein of unknown function DUF820  27.48 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1626  protein of unknown function DUF820  27.48 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  25 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  24.82 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  26.51 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0563  hypothetical protein  32.65 
 
 		 109 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  29.7 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  25.41 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>