151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0540 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3054  protein of unknown function DUF820  59.36 
 
 		 189 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3808  protein of unknown function DUF820  57.07 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  50.27 
 
 		 190 aa  174  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  53.59 
 
 		 191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2361  hypothetical protein  47.87 
 
 		 191 aa  171  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5334  protein of unknown function DUF820  49.15 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.510489  normal  0.17641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  47.49 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3807  protein of unknown function DUF820  47.12 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0988  protein of unknown function DUF820  49.67 
 
 		 188 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28586 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0961  protein of unknown function DUF820  49.67 
 
 		 190 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4826  hypothetical protein  45.57 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0786797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  48.1 
 
 		 217 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  45.2 
 
 		 198 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  39.57 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2319  protein of unknown function DUF820  37.79 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  40.43 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2268  protein of unknown function DUF820  37.79 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  40.51 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  40.51 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2079  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204058  hitchhiker  0.000474177 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2432  hypothetical protein  40 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal  0.365453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4343  protein of unknown function DUF820  36.7 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4405  protein of unknown function DUF820  36.17 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738575  hitchhiker  0.000905365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1588  hypothetical protein  42.68 
 
 		 194 aa  130  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.856601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2551  protein of unknown function DUF820  40.83 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3545  protein of unknown function DUF820  40.82 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307984 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1860  hypothetical protein  37.93 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.571985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  44.9 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  38.2 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0248  protein of unknown function DUF820  35.33 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  41.25 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0036  hypothetical protein  35.39 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000477397  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2565  protein of unknown function DUF820  33.71 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0390  protein of unknown function DUF820  35.79 
 
 		 209 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  37.7 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5140  protein of unknown function DUF820  34.08 
 
 		 200 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2595  hypothetical protein  34.04 
 
 		 230 aa  104  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0392428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2885  hypothetical protein  33.52 
 
 		 190 aa  104  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142642  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2886  hypothetical protein  36.02 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  31.69 
 
 		 193 aa  101  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2266  protein of unknown function DUF820  31.98 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0466597  hitchhiker  0.000108655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0741  protein of unknown function DUF820  36.52 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2541  protein of unknown function DUF820  38.24 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1255  protein of unknown function DUF820  28.88 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1286  protein of unknown function DUF820  28.34 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3925  hypothetical protein  32.96 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.948868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3386  protein of unknown function DUF820  27.93 
 
 		 194 aa  91.3  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3475  protein of unknown function DUF820  31.89 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2628  protein of unknown function DUF820  31.89 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4644  hypothetical protein  34.62 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148884 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0173  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  34.43 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5107  protein of unknown function DUF820  34.62 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.604393  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4909  protein of unknown function DUF820  39.32 
 
 		 192 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  32.68 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2718  protein of unknown function DUF820  30.29 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.602399  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3717  hypothetical protein  32.58 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.0468458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5185  protein of unknown function DUF820  33.72 
 
 		 188 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3395  protein of unknown function DUF820  29.71 
 
 		 191 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1727  protein of unknown function DUF820  29.26 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1751  protein of unknown function DUF820  28.72 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3945  protein of unknown function DUF820  29.78 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000129802  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1601  protein of unknown function DUF820  30.46 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3895  protein of unknown function DUF820  29.78 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1626  protein of unknown function DUF820  30.46 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3157  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4290  protein of unknown function DUF820  28.34 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4337  protein of unknown function DUF820  29.55 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1442  hypothetical protein  30.46 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4350  protein of unknown function DUF820  28.34 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  28.85 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1422  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0659527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0573  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  28.85 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  38.1 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  31.29 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3531  hypothetical protein  32.39 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  29.55 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  28.85 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  34.87 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0563  hypothetical protein  34.74 
 
 		 109 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  29.05 
 
 		 202 aa  72  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  27.22 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  28.21 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  33.15 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  33.15 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4308  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  29.49 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  32.43 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  26.37 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  27.53 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  31.74 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  28.34 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  30.77 
 
 		 244 aa  67.8  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  26.92 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  29.3 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  27.56 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5199  hypothetical protein  30.13 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>