139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4778 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3386  protein of unknown function DUF820  52.51 
 
 
194 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2565  protein of unknown function DUF820  45.55 
 
 
194 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1727  protein of unknown function DUF820  43.72 
 
 
191 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0036  hypothetical protein  42.55 
 
 
192 aa  151  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000477397  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1751  protein of unknown function DUF820  44.26 
 
 
191 aa  150  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2885  hypothetical protein  40.74 
 
 
190 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1442  hypothetical protein  37.97 
 
 
197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4909  protein of unknown function DUF820  41.3 
 
 
192 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  42.55 
 
 
189 aa  140  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3395  protein of unknown function DUF820  40.98 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2718  protein of unknown function DUF820  40.98 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.602399  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  38.46 
 
 
190 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1286  protein of unknown function DUF820  38.42 
 
 
193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1255  protein of unknown function DUF820  37.89 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2266  protein of unknown function DUF820  38.25 
 
 
195 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0466597  hitchhiker  0.000108655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2551  protein of unknown function DUF820  40.33 
 
 
190 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0390  protein of unknown function DUF820  38.25 
 
 
209 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1601  protein of unknown function DUF820  38.95 
 
 
200 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1626  protein of unknown function DUF820  38.95 
 
 
200 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  37.57 
 
 
188 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3925  hypothetical protein  40.11 
 
 
188 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.948868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5140  protein of unknown function DUF820  38.8 
 
 
200 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3157  protein of unknown function DUF820  35.98 
 
 
191 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3475  protein of unknown function DUF820  39.44 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2628  protein of unknown function DUF820  39.44 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4290  protein of unknown function DUF820  38.25 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  37.5 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  35.6 
 
 
186 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  38.33 
 
 
196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4350  protein of unknown function DUF820  37.7 
 
 
195 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4405  protein of unknown function DUF820  34.21 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738575  hitchhiker  0.000905365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0573  protein of unknown function DUF820  36.84 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4343  protein of unknown function DUF820  33.68 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2361  hypothetical protein  37.08 
 
 
191 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3945  protein of unknown function DUF820  37.63 
 
 
195 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000129802  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3895  protein of unknown function DUF820  37.63 
 
 
195 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2886  hypothetical protein  36.05 
 
 
190 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4337  protein of unknown function DUF820  36.76 
 
 
195 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  39.22 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  36.67 
 
 
198 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5334  protein of unknown function DUF820  34.92 
 
 
195 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.510489  normal  0.17641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0741  protein of unknown function DUF820  34.41 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2432  hypothetical protein  35.56 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal  0.365453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4826  hypothetical protein  37.79 
 
 
193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0786797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0988  protein of unknown function DUF820  38.04 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1588  hypothetical protein  36.21 
 
 
194 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.856601  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  39.33 
 
 
191 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0961  protein of unknown function DUF820  38.04 
 
 
190 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  38.1 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  38.1 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3807  protein of unknown function DUF820  32.02 
 
 
189 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3054  protein of unknown function DUF820  34.07 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3808  protein of unknown function DUF820  32.97 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3545  protein of unknown function DUF820  32.61 
 
 
194 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2319  protein of unknown function DUF820  32.97 
 
 
189 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2268  protein of unknown function DUF820  32.97 
 
 
189 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1860  hypothetical protein  32.78 
 
 
184 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.571985  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  36.71 
 
 
187 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  31.28 
 
 
209 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  31.69 
 
 
189 aa  101  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0248  protein of unknown function DUF820  34.25 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2079  hypothetical protein  32.58 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204058  hitchhiker  0.000474177 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3717  hypothetical protein  30.73 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.0468458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2595  hypothetical protein  34.69 
 
 
230 aa  95.1  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0392428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
203 aa  94.7  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2541  protein of unknown function DUF820  31.91 
 
 
194 aa  93.6  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  29.61 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  30.05 
 
 
193 aa  89.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0173  protein of unknown function DUF820  30.51 
 
 
209 aa  89  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2001  protein of unknown function DUF820  30.99 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  29.83 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 
187 aa  82  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  28.74 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1422  hypothetical protein  36.59 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0659527  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1810  hypothetical protein  27.78 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00248062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  28.18 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4308  protein of unknown function DUF820  27.66 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  29.93 
 
 
257 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  27.45 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4968  protein of unknown function DUF820  31.39 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000167718  unclonable  0.00000000000000331839 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4644  hypothetical protein  29.28 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5107  protein of unknown function DUF820  29.28 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.604393  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  28.65 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  26.47 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  27.81 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  26.75 
 
 
218 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5199  hypothetical protein  31.91 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  29.94 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5185  protein of unknown function DUF820  28.42 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  28.07 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  29.08 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2041  hypothetical protein  25.85 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  28.48 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  25 
 
 
241 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  26.29 
 
 
244 aa  61.6  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  28.37 
 
 
245 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  26.86 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3531  hypothetical protein  22.4 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151198  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>