107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3717 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010580  Bind_3717  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.0468458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3807  protein of unknown function DUF820  35.45 
 
 
189 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1860  hypothetical protein  33.71 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.571985  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  33.52 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  35.48 
 
 
209 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  34.39 
 
 
190 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2886  hypothetical protein  35.71 
 
 
190 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  35.23 
 
 
196 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4308  protein of unknown function DUF820  34.08 
 
 
184 aa  101  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  32.95 
 
 
203 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2361  hypothetical protein  32.95 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  30.46 
 
 
189 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  30.46 
 
 
189 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  31.89 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4826  hypothetical protein  31.72 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0786797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  37.32 
 
 
191 aa  97.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  31.21 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  30.73 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3808  protein of unknown function DUF820  30.06 
 
 
187 aa  94.7  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  31.38 
 
 
201 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1255  protein of unknown function DUF820  33.15 
 
 
193 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2268  protein of unknown function DUF820  30.22 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2319  protein of unknown function DUF820  30.22 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2885  hypothetical protein  30.68 
 
 
190 aa  92  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142642  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  30.6 
 
 
186 aa  91.3  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3054  protein of unknown function DUF820  32.37 
 
 
189 aa  91.3  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0741  protein of unknown function DUF820  31.89 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2628  protein of unknown function DUF820  29.89 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1286  protein of unknown function DUF820  32.58 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3475  protein of unknown function DUF820  29.89 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0036  hypothetical protein  30.51 
 
 
192 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000477397  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2551  protein of unknown function DUF820  31.84 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0248  protein of unknown function DUF820  28.41 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0390  protein of unknown function DUF820  30.57 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  26.92 
 
 
193 aa  89  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  28.42 
 
 
194 aa  88.6  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  32.58 
 
 
189 aa  88.2  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1442  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  87.8  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  30.85 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4909  protein of unknown function DUF820  31.55 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  29.89 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4343  protein of unknown function DUF820  31.64 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1810  hypothetical protein  32.58 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00248062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2079  hypothetical protein  28.8 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204058  hitchhiker  0.000474177 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4405  protein of unknown function DUF820  31.64 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738575  hitchhiker  0.000905365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0573  protein of unknown function DUF820  28.95 
 
 
196 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5140  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2266  protein of unknown function DUF820  29.35 
 
 
195 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0466597  hitchhiker  0.000108655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2001  protein of unknown function DUF820  32.8 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3545  protein of unknown function DUF820  32.03 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307984 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2432  hypothetical protein  27.57 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal  0.365453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2595  hypothetical protein  31.25 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0392428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0961  protein of unknown function DUF820  34.88 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0988  protein of unknown function DUF820  34.11 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28586 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3157  protein of unknown function DUF820  27.89 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1751  protein of unknown function DUF820  30.98 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3925  hypothetical protein  29.89 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.948868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1727  protein of unknown function DUF820  30.98 
 
 
191 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5107  protein of unknown function DUF820  34.46 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.604393  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4644  hypothetical protein  34.46 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  30 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  28.96 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  32.28 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  31.38 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3395  protein of unknown function DUF820  27.12 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2718  protein of unknown function DUF820  27.12 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.602399  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1601  protein of unknown function DUF820  27.75 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2565  protein of unknown function DUF820  28.02 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1626  protein of unknown function DUF820  27.75 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  31.75 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2541  protein of unknown function DUF820  27.84 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0173  protein of unknown function DUF820  26.01 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2041  hypothetical protein  29.78 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5185  protein of unknown function DUF820  32.77 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5334  protein of unknown function DUF820  34.4 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.510489  normal  0.17641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  29.1 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4337  protein of unknown function DUF820  26.6 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4350  protein of unknown function DUF820  27.47 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3386  protein of unknown function DUF820  29.61 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127932  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0563  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4290  protein of unknown function DUF820  27.47 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  29.95 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1588  hypothetical protein  25.57 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.856601  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3895  protein of unknown function DUF820  25.67 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3945  protein of unknown function DUF820  25.67 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000129802  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3531  hypothetical protein  27.84 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151198  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5199  hypothetical protein  25.66 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  27.43 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  28.35 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  28.16 
 
 
207 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  31.21 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  29.6 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  26.28 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  24.48 
 
 
207 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4289  hypothetical protein  26.74 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4968  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000167718  unclonable  0.00000000000000331839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1422  hypothetical protein  28.46 
 
 
129 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0659527  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  25.27 
 
 
190 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  23.03 
 
 
187 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  23.18 
 
 
187 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>