136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6783 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  396  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  70.81 
 
 
206 aa  274  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  41.53 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  36.26 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2885  hypothetical protein  31.95 
 
 
190 aa  95.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  29.67 
 
 
194 aa  94.4  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  34.02 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  33.56 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  31.75 
 
 
191 aa  91.7  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1810  hypothetical protein  35.8 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00248062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  29.61 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0036  hypothetical protein  29.05 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000477397  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2001  protein of unknown function DUF820  32.8 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  32.02 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  32.8 
 
 
188 aa  89  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  29.8 
 
 
217 aa  88.2  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3717  hypothetical protein  30.85 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.0468458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  29.57 
 
 
209 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4343  protein of unknown function DUF820  27.53 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4405  protein of unknown function DUF820  27.53 
 
 
190 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738575  hitchhiker  0.000905365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4337  protein of unknown function DUF820  26.7 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  31.75 
 
 
188 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2361  hypothetical protein  31.32 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  31.43 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0248  protein of unknown function DUF820  31.71 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  38.89 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  27.68 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  24.43 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  33.91 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1601  protein of unknown function DUF820  26.7 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1626  protein of unknown function DUF820  26.7 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5185  protein of unknown function DUF820  34.43 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1860  hypothetical protein  27.43 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.571985  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0741  protein of unknown function DUF820  30.99 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3807  protein of unknown function DUF820  29.78 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2541  protein of unknown function DUF820  32.62 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0390  protein of unknown function DUF820  26.46 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0961  protein of unknown function DUF820  28.74 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0988  protein of unknown function DUF820  28.16 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2079  hypothetical protein  28.57 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204058  hitchhiker  0.000474177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  30.73 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4644  hypothetical protein  35.97 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5199  hypothetical protein  30.77 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5107  protein of unknown function DUF820  35.97 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.604393  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2319  protein of unknown function DUF820  27.12 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2041  hypothetical protein  32.39 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2268  protein of unknown function DUF820  27.12 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4350  protein of unknown function DUF820  25.63 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5140  protein of unknown function DUF820  25.82 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4826  hypothetical protein  25.14 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0786797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3808  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3054  protein of unknown function DUF820  28.81 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  29.55 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4909  protein of unknown function DUF820  27.07 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  27.42 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3475  protein of unknown function DUF820  23.04 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  21.79 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2628  protein of unknown function DUF820  23.04 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4290  protein of unknown function DUF820  27 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  21.79 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2551  protein of unknown function DUF820  28.82 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4308  protein of unknown function DUF820  27.43 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0173  protein of unknown function DUF820  27.37 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  37.27 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3925  hypothetical protein  28.99 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.948868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2886  hypothetical protein  27.11 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5334  protein of unknown function DUF820  28.38 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.510489  normal  0.17641 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2432  hypothetical protein  27.06 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal  0.365453 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  30.07 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2565  protein of unknown function DUF820  28.02 
 
 
194 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3395  protein of unknown function DUF820  23.5 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1442  hypothetical protein  23.76 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2266  protein of unknown function DUF820  24.72 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0466597  hitchhiker  0.000108655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2718  protein of unknown function DUF820  23.5 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.602399  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3157  protein of unknown function DUF820  24.73 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1751  protein of unknown function DUF820  26.95 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2595  hypothetical protein  25.52 
 
 
230 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0392428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1588  hypothetical protein  29.92 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.856601  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0573  protein of unknown function DUF820  23.2 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  26.9 
 
 
251 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1727  protein of unknown function DUF820  27.54 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3545  protein of unknown function DUF820  25.79 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3386  protein of unknown function DUF820  23.08 
 
 
194 aa  61.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127932  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1255  protein of unknown function DUF820  21.62 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1286  protein of unknown function DUF820  21.08 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3531  hypothetical protein  32.06 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151198  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  29.92 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  27.56 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4289  hypothetical protein  30.68 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  24.7 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  28.27 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  26.77 
 
 
181 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  30.89 
 
 
186 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  22.1 
 
 
187 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  32.2 
 
 
184 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  27.78 
 
 
241 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  31.43 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4621  protein of unknown function DUF820  27.35 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  27.2 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3945  protein of unknown function DUF820  21.05 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000129802  normal  0.0173908 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>