192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1336 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  89.66 
 
 
218 aa  374  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  88.18 
 
 
203 aa  361  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  82.27 
 
 
203 aa  341  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  61.88 
 
 
203 aa  264  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  55.21 
 
 
207 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  54.74 
 
 
207 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  50.78 
 
 
206 aa  167  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  55.32 
 
 
227 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  45.41 
 
 
202 aa  158  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  46.24 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  51.55 
 
 
201 aa  144  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  44.05 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  44.71 
 
 
197 aa  121  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  42.54 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  38.42 
 
 
187 aa  117  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  40.31 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  42.75 
 
 
182 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  35.23 
 
 
187 aa  104  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  39.25 
 
 
203 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  41.18 
 
 
183 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  41.18 
 
 
200 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  40.97 
 
 
189 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  41.79 
 
 
188 aa  98.2  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  40.16 
 
 
180 aa  98.2  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  37.84 
 
 
182 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  34.86 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  33.15 
 
 
257 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  34.21 
 
 
191 aa  91.3  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  34.93 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  33.9 
 
 
189 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  32.8 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  35.48 
 
 
209 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  30.46 
 
 
191 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  29.94 
 
 
200 aa  85.1  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  32.74 
 
 
187 aa  84.7  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  31.89 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  34.76 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  30.9 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  33.71 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  33.67 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  36.65 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  27.72 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  35 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  29.35 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  34.48 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  34.68 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  32.24 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  27.17 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  30.81 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  27.89 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  33.52 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  26.49 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  33.57 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  29.67 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  34.59 
 
 
241 aa  71.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  32.59 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  32.62 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  29.38 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  28.96 
 
 
251 aa  68.2  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  32.72 
 
 
223 aa  67.8  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  34.53 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  35.1 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  31.01 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  30.27 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  30.43 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  31.88 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  34.81 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  34.71 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  33.73 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  32.85 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  30.36 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  30 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  27.36 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  25.97 
 
 
193 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  26.8 
 
 
202 aa  61.2  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  31.44 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5110  protein of unknown function DUF820  31.75 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10814  normal  0.277047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  33.92 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  32.86 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  26.32 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  34.81 
 
 
233 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  35.38 
 
 
184 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  29.85 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  25.73 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  30.22 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  36.72 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  30.81 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  31.21 
 
 
203 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3390  response regulator receiver protein  36.23 
 
 
197 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  32.09 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  36.96 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  34.23 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2290  protein of unknown function DUF820  27.42 
 
 
126 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  31.69 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  24.32 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  30.23 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>