168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1335 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  91.13 
 
 
203 aa  378  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  88.18 
 
 
203 aa  361  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  81.77 
 
 
218 aa  344  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  61.58 
 
 
203 aa  262  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  51.56 
 
 
207 aa  184  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  52.63 
 
 
207 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  53.89 
 
 
206 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  57.45 
 
 
227 aa  168  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  47.45 
 
 
202 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  54.04 
 
 
201 aa  150  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  46.77 
 
 
203 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  47.62 
 
 
201 aa  138  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  47.06 
 
 
197 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  43.89 
 
 
197 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  40.11 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  35.8 
 
 
187 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  43.53 
 
 
200 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  41.22 
 
 
182 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  42.07 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  32.95 
 
 
187 aa  98.6  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  37.3 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  33.87 
 
 
193 aa  95.5  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  37.17 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  36.17 
 
 
188 aa  91.7  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  37.5 
 
 
183 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  33.9 
 
 
189 aa  87.8  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  33.15 
 
 
257 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  32.26 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  32 
 
 
184 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  30.06 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  36.36 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  32.14 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  35.43 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  35.81 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  31.64 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  34.93 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  33.54 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  31.35 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  36.36 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  32.02 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  36.25 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  33.85 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  28.09 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  35.63 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  30.98 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  29.69 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  30.43 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  33.55 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  35.21 
 
 
245 aa  74.7  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  34.97 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  32.87 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  29.57 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  33.11 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  31.69 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  27.03 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  29.32 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  31.35 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  40.74 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  29.03 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  30.69 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  34.44 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  33.13 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  30.05 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  30.22 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  32.47 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  31.82 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  37.68 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  28.35 
 
 
207 aa  61.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  34.12 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  33.71 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  30 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  32.61 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  34.09 
 
 
214 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  32.33 
 
 
219 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  30.99 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  25.73 
 
 
188 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  34.72 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  25.15 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  30.39 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  31.12 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  32.26 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  30.56 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2290  protein of unknown function DUF820  28.46 
 
 
126 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  30.25 
 
 
223 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  30.65 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1143  hypothetical protein  29.89 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  30.05 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  32.28 
 
 
257 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  30.83 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  32.6 
 
 
233 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  31.55 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3390  response regulator receiver protein  35.46 
 
 
197 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  27.13 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  32.14 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  34.31 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  46.94 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>