151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3554 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  410  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  91.13 
 
 		 203 aa  378  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  83.74 
 
 		 218 aa  356  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  82.27 
 
 		 203 aa  341  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  59.61 
 
 		 203 aa  252  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  51.04 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  51.58 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  52.02 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  55.32 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  45.83 
 
 		 202 aa  157  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  45.26 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  51.55 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  46.3 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  46.79 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  41.44 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  41.51 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  46.1 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  32.95 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  37.84 
 
 		 189 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  38.17 
 
 		 182 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  32.62 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  36.65 
 
 		 191 aa  92.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  36.02 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  36.03 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  33.14 
 
 		 184 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  33.9 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  35.04 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  31.03 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  29.83 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  32.26 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  33.52 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  35.42 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  36 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  34.78 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  34.44 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  36.36 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  33.15 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  31.71 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  30.17 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  28.26 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  32.24 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  31.89 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  29.35 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  32.85 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  31.94 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  29.76 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  33.71 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  35.9 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  31.55 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  29.67 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  28.8 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  29.19 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  33.1 
 
 		 245 aa  72  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  30.56 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  34.88 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  28.49 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  35.88 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  30.26 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  31.55 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  31.35 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  29.55 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  28.87 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  32.93 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  30.41 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  29.05 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  31.18 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  35.61 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  31.1 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  31.88 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  31.88 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  26.32 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  30.88 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  27.72 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  31.95 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  31.39 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  30.95 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  25.73 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  31.69 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  30 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  32.12 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  31.54 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  34.03 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  31.36 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  29.9 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  29.67 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  32.52 
 
 		 257 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  31.55 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  33.81 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2290  protein of unknown function DUF820  26.02 
 
 		 126 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  30.22 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  29.29 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3390  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  28.67 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  38.55 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  32.85 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  34.31 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5185  protein of unknown function DUF820  29.7 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1143  hypothetical protein  29.48 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4644  hypothetical protein  29.7 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>