39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1217 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  609  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  95.87 
 
 		 345 aa  448  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  95.22 
 
 		 321 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  74.01 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  76.52 
 
 		 289 aa  360  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  74.62 
 
 		 340 aa  351  8.999999999999999e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  78.72 
 
 		 350 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  75.82 
 
 		 376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  74.34 
 
 		 290 aa  333  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  73.95 
 
 		 339 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  75.32 
 
 		 314 aa  318  7.999999999999999e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  75.91 
 
 		 343 aa  308  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  75.32 
 
 		 310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  77.57 
 
 		 402 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  74.25 
 
 		 312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  50.21 
 
 		 333 aa  235  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  50.6 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  49.03 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  49.78 
 
 		 302 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  49.36 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  49.08 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  50.49 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  49.31 
 
 		 160 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  41.04 
 
 		 249 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  37.38 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  29.6 
 
 		 251 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  29.03 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  41.57 
 
 		 108 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  33.76 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  33.19 
 
 		 244 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  27.71 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  24.88 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  35.64 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  30.98 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  33.87 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  25.81 
 
 		 236 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  25.7 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  27.16 
 
 		 230 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  38.71 
 
 		 205 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>