19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2205 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  220  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  61.39 
 
 
257 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  45.12 
 
 
319 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  48.28 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  48.15 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  45.12 
 
 
330 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  45.12 
 
 
332 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  34.52 
 
 
333 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  38.75 
 
 
319 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  43.28 
 
 
290 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  43.21 
 
 
376 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  43.21 
 
 
350 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  43.21 
 
 
340 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  30.49 
 
 
249 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  41.25 
 
 
345 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  41.25 
 
 
314 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  44.78 
 
 
321 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  45.95 
 
 
339 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  36.59 
 
 
402 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>