208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0813 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  74.5 
 
 
201 aa  301  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  53.55 
 
 
197 aa  190  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  50.82 
 
 
197 aa  187  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  50.82 
 
 
197 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  54.64 
 
 
200 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  47.62 
 
 
203 aa  138  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  46.3 
 
 
218 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  46.41 
 
 
207 aa  130  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  46.48 
 
 
187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  46.3 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  44.05 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  45.34 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  38 
 
 
207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  39.53 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  42.86 
 
 
187 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  42.14 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  42.04 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  42.47 
 
 
188 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  37.58 
 
 
182 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  43.57 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  39.55 
 
 
185 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  42.86 
 
 
203 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  37.36 
 
 
184 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  43.11 
 
 
191 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  40.71 
 
 
227 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  44.3 
 
 
207 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  35.75 
 
 
182 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  38.97 
 
 
199 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  37.7 
 
 
206 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  39.29 
 
 
200 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  39.6 
 
 
189 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  37.66 
 
 
257 aa  99.8  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  40.25 
 
 
197 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  36.48 
 
 
202 aa  95.9  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  32.96 
 
 
193 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  38.78 
 
 
253 aa  95.1  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  34.39 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  34.83 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  32.8 
 
 
241 aa  92.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  37.75 
 
 
189 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  33.67 
 
 
192 aa  92  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  38.59 
 
 
195 aa  91.7  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  33.15 
 
 
187 aa  91.3  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  33.12 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  35.22 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  35.33 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  39.47 
 
 
186 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  34 
 
 
187 aa  87.8  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  35.85 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  35.71 
 
 
204 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  33.97 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  35.22 
 
 
191 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  36.81 
 
 
251 aa  85.1  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  29.73 
 
 
192 aa  84.7  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  36 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  34.44 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  27.98 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  33.16 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  35.33 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  35.67 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  32.43 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  32.05 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  31.03 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  34.18 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  34.01 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  38.51 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  31.33 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  33.76 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  30.3 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  33.53 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  31.29 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  31.41 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  32.28 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  34.08 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  33.76 
 
 
233 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3390  response regulator receiver protein  31.95 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  31.55 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  29.52 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  29.93 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  31.87 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  31.06 
 
 
205 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  30.57 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  28.47 
 
 
257 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  29.56 
 
 
205 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  30.25 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  32.41 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  32.33 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  31.51 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  28.81 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4511  protein of unknown function DUF820  31.11 
 
 
195 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  31.67 
 
 
195 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  31.54 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  29.83 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  25.95 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  28.36 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  34.04 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>