217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1528 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  55.73 
 
 
202 aa  222  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  48.91 
 
 
192 aa  204  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  51.61 
 
 
190 aa  201  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  51.83 
 
 
190 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  50.26 
 
 
195 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  49.2 
 
 
191 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  50.27 
 
 
190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  47.06 
 
 
193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  42.86 
 
 
207 aa  176  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  45.79 
 
 
190 aa  170  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  45.9 
 
 
195 aa  166  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  44.79 
 
 
200 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  44.15 
 
 
195 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  44.15 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  45.99 
 
 
191 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  43.78 
 
 
197 aa  160  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  42.41 
 
 
192 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  42.44 
 
 
198 aa  157  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  43.75 
 
 
199 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  42.08 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  40.11 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  44.71 
 
 
187 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  39.57 
 
 
189 aa  143  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  38.14 
 
 
207 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  38.12 
 
 
191 aa  137  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  36.79 
 
 
193 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  41.76 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  36.65 
 
 
200 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  39.78 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  41.67 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  37.77 
 
 
244 aa  125  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  37.77 
 
 
251 aa  121  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  35.6 
 
 
241 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  34.97 
 
 
181 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  35.48 
 
 
188 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  39.25 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  36.02 
 
 
187 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  33.88 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  35.98 
 
 
201 aa  104  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
242 aa  104  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  36.9 
 
 
183 aa  104  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  32.99 
 
 
197 aa  101  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  33.51 
 
 
187 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  34.9 
 
 
245 aa  98.6  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  31.72 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  33.69 
 
 
257 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  33.86 
 
 
182 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  34.52 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  34.72 
 
 
203 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 
257 aa  92.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  33.67 
 
 
201 aa  92  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  30.93 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  31.05 
 
 
197 aa  89  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  29.26 
 
 
200 aa  87.8  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  34.22 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  31.61 
 
 
253 aa  81.3  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  30.32 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  30.81 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  33.53 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  28.99 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  31.35 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  29.27 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  30.3 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  30.81 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  30.72 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  29.05 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  31.35 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  28.22 
 
 
202 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  30.1 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1085  hypothetical protein  34.75 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  29.56 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2595  hypothetical protein  29.27 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0392428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  28.65 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  28.74 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  31.03 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2001  protein of unknown function DUF820  32.37 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  29.05 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  31.65 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  35.25 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  29.45 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  26.94 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  31.65 
 
 
188 aa  62  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  26.74 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  27.54 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2541  protein of unknown function DUF820  28.72 
 
 
194 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  32.43 
 
 
153 aa  61.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  33.09 
 
 
206 aa  61.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
186 aa  61.2  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0248  protein of unknown function DUF820  33.56 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2290  protein of unknown function DUF820  29.69 
 
 
126 aa  60.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2027  hypothetical protein  58.7 
 
 
52 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  26.8 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  26.8 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  30.81 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  26.98 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  27.71 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  30.53 
 
 
186 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>