107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2526 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  38.73 
 
 
219 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  36.61 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  34.59 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  39.33 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  38.93 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  34.08 
 
 
194 aa  82  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  32.4 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  37.91 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  39.22 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  34.46 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  34.55 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  36.26 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  36.84 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  36.17 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  36.17 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  33.53 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  35.29 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  32.81 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2118  protein of unknown function DUF820  41.26 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  38.46 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  32.58 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  34 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  38.3 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  32.39 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  30.91 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  39.6 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  32.72 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  31.37 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  36 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  32.34 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  35.94 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  31.91 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  34.59 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  32.89 
 
 
201 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  31.39 
 
 
184 aa  58.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  32.62 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  32.75 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  26.83 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  27.93 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  37.5 
 
 
206 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  35.16 
 
 
227 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  35.06 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  35.33 
 
 
187 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  33.85 
 
 
184 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  30.56 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  32.62 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  29.37 
 
 
183 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  27.87 
 
 
187 aa  52.8  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  36.59 
 
 
184 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  27.94 
 
 
182 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  37.72 
 
 
188 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0820  protein of unknown function DUF820  29.45 
 
 
192 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0980811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  29.71 
 
 
186 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  27.33 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3647  protein of unknown function DUF820  33.11 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0632204  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  33.55 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  28.75 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  27.56 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4511  protein of unknown function DUF820  27.85 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  31.33 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3648  protein of unknown function DUF820  30.88 
 
 
218 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  30.61 
 
 
193 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  30.95 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  26.95 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  26.39 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  35.07 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  27.14 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  29.5 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1522  hypothetical protein  25.35 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.793245  hitchhiker  0.00163452 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  31.01 
 
 
186 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  27.03 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  29.11 
 
 
191 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  32.91 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8443  protein of unknown function DUF820  36.89 
 
 
142 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0498606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0721  protein of unknown function DUF820  29.1 
 
 
254 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00402744  normal  0.197954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0693  protein of unknown function DUF820  29.1 
 
 
254 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  27.15 
 
 
193 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  30.69 
 
 
205 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  28.78 
 
 
190 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  32.72 
 
 
205 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  26.8 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  32.35 
 
 
189 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  26.24 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  35.14 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  26.53 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0580  protein of unknown function DUF820  27.41 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  26.01 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  29.86 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  29.25 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  25.48 
 
 
218 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  30.56 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  23.36 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1433  protein of unknown function DUF820  28.03 
 
 
180 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>