161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0553 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  427  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  48 
 
 
184 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  47.43 
 
 
184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  45.71 
 
 
184 aa  153  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  44.57 
 
 
184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1833  hypothetical protein  45.06 
 
 
185 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  37.5 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2463  protein of unknown function DUF820  34.81 
 
 
185 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  33.13 
 
 
191 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  32.54 
 
 
193 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  32.52 
 
 
191 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2406  protein of unknown function DUF820  32.91 
 
 
185 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1238  protein of unknown function DUF820  33.16 
 
 
193 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1268  protein of unknown function DUF820  33.16 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  hitchhiker  0.00936719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2886  protein of unknown function DUF820  31.65 
 
 
184 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2366  protein of unknown function DUF820  31.45 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1790  hypothetical protein  31.95 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5097  protein of unknown function DUF820  32.6 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3010  protein of unknown function DUF820  31.79 
 
 
191 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2128  hypothetical protein  32.08 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0341  protein of unknown function DUF820  34 
 
 
192 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000574884  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1895  protein of unknown function DUF820  30.59 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1919  protein of unknown function DUF820  30.59 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2598  protein of unknown function DUF820  32.04 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.855565  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5150  protein of unknown function DUF820  32.89 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0734  protein of unknown function DUF820  32.5 
 
 
185 aa  85.5  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1596  protein of unknown function DUF820  30.29 
 
 
194 aa  85.9  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1440  protein of unknown function DUF820  27.62 
 
 
208 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1209  protein of unknown function DUF820  30 
 
 
195 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2042  protein of unknown function DUF820  30.19 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000371183  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2017  protein of unknown function DUF820  30.19 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2438  protein of unknown function DUF820  32.69 
 
 
187 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.873691  normal  0.192917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2387  protein of unknown function DUF820  32.69 
 
 
187 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0074  protein of unknown function DUF820  28.82 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.716542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0076  protein of unknown function DUF820  28.82 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5071  protein of unknown function DUF820  30.05 
 
 
190 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2985  protein of unknown function DUF820  29.19 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2049  protein of unknown function DUF820  28.07 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4062  hypothetical protein  29.21 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.654583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2023  protein of unknown function DUF820  28.07 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0713  protein of unknown function DUF820  27.88 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.277122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3416  protein of unknown function DUF820  32.45 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5248  protein of unknown function DUF820  30.91 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.73684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0999  protein of unknown function DUF820  30.46 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4017  protein of unknown function DUF820  28.25 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.389998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3227  protein of unknown function DUF820  30.86 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2428  protein of unknown function DUF820  27.66 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0267  protein of unknown function DUF820  26.42 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1761  protein of unknown function DUF820  29.08 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2170  protein of unknown function DUF820  26.98 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0468  protein of unknown function DUF820  30.19 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0619139  normal  0.13059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3284  protein of unknown function DUF820  32.45 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000638939  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0267  protein of unknown function DUF820  26.42 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2815  protein of unknown function DUF820  32.45 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0572  protein of unknown function DUF820  27.47 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1028  protein of unknown function DUF820  29.14 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1060  hypothetical protein  32.39 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000122836  decreased coverage  0.00000222645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2794  protein of unknown function DUF820  27.95 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274491  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3323  protein of unknown function DUF820  27.95 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0100  hypothetical protein  29.22 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637727  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4048  hypothetical protein  43.02 
 
 
123 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726239  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1789  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0815635  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4918  protein of unknown function DUF820  28.77 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  32.07 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0963  protein of unknown function DUF820  32 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000104175  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3773  hypothetical protein  34.55 
 
 
201 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211833  normal  0.137828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4387  hypothetical protein  25.79 
 
 
200 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3972  protein of unknown function DUF820  26.4 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3326  hypothetical protein  26.47 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.138444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  31.03 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  29.26 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1493  protein of unknown function DUF820  26.42 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000252154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  29.58 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  31.19 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0643  hypothetical protein  27.66 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263684  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  29.73 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2896  protein of unknown function DUF820  32.28 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.627457  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2465  protein of unknown function DUF820  27.22 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  30.1 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  28.82 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  34.08 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  31.76 
 
 
188 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  32.46 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0891  protein of unknown function DUF820  29.11 
 
 
189 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2174  protein of unknown function DUF820  26.71 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0729554 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1466  hypothetical protein  28.66 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0533838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  31.87 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  27.33 
 
 
215 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3644  protein of unknown function DUF820  26.58 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  31.89 
 
 
203 aa  61.6  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0102  hypothetical protein  25.15 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  29.61 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1350  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.946881  hitchhiker  0.0000000359977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1321  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2162  hypothetical protein  31.85 
 
 
198 aa  58.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1609  protein of unknown function DUF820  29.84 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  26.95 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  28.88 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5396  protein of unknown function DUF820  30.84 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>