224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3790 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  92.39 
 
 		 197 aa  359  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  83.25 
 
 		 197 aa  340  8e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  78.68 
 
 		 200 aa  304  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  60.11 
 
 		 201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  50.82 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  40.78 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  38.86 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  38.86 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  41 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  38.42 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  43.89 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  41.67 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  43.24 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  42.54 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  35.75 
 
 		 183 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  35.39 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  36.21 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  41.44 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  41.73 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  37.27 
 
 		 180 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  40.56 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  38.85 
 
 		 189 aa  111  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  38.92 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  37.95 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  44.08 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  32.97 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  37.57 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  39.34 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  32.98 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  40.13 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  33.71 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  36 
 
 		 257 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  41.25 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  35.64 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  41.79 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  32.08 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  31.58 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  31.67 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  39.05 
 
 		 200 aa  95.5  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  34.42 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  37.13 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  32.2 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  35.56 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  31.07 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  32.24 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  31.89 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  36.26 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  36.73 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  36.77 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  40.88 
 
 		 227 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  29.35 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  33.13 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  34.25 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  31.05 
 
 		 191 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  29.63 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  31.02 
 
 		 184 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  34.93 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  36.81 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  38.19 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  32.02 
 
 		 207 aa  85.1  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  30.22 
 
 		 245 aa  85.1  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  40.71 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  26.78 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  31.67 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  31.02 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  32.4 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  37.5 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  28.8 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  35.64 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  30.94 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  33.89 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4511  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  30.39 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  34.96 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  32.77 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  32.2 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  32.2 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0094  hypothetical protein  35.87 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000049462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  37.75 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  31.51 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  30.87 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  34.36 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  30.92 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  31.64 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  33.56 
 
 		 244 aa  72  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  27.37 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  30.43 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  31.03 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  27.37 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  33.52 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  34.36 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  31.32 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  29.11 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  31.47 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3647  protein of unknown function DUF820  32.1 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0749103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>