91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3352 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1672  protein of unknown function DUF820  37.13 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158982 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  38.04 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  40.62 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  32.28 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  30.62 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  34.42 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  35.58 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  31.15 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1348  hypothetical protein  43.53 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0417426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  28.22 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  32.24 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  26.67 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  32.47 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  31.95 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  29.37 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  33.12 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  28.73 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  27.27 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  30.18 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  28.16 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  28.37 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  23.68 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  29.61 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  25.61 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  30.6 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  28.65 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  31.58 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  29.66 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  23.68 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  27.34 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  31.71 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  24.84 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  30.41 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  28.39 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  29.22 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  22 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  26.98 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  25 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  30.08 
 
 		 180 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  30.66 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  32.87 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  27.72 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0099  protein of unknown function DUF820  29.55 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3115  protein of unknown function DUF820  29.05 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0751383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  30.13 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  23.78 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  28.05 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  29.66 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  22.97 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  26.7 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  28.46 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  26.88 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  32.41 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  28.39 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  27.61 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  32.43 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  32.68 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8443  protein of unknown function DUF820  40.3 
 
 		 142 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0498606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  28.03 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  29.95 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  32.03 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  25.36 
 
 		 245 aa  45.1  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4826  hypothetical protein  26.92 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0786797 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  29.14 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  27.38 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  26.76 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  27.36 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0988  protein of unknown function DUF820  28.03 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28586 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  27.5 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  22.44 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  28.08 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  28.3 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0961  protein of unknown function DUF820  28.03 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  30.71 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  27.08 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  31.39 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  27.08 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3259  protein of unknown function DUF820  39.66 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00168542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  22.96 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  34.44 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  28 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  24.55 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0030  protein of unknown function DUF820  33.09 
 
 		 179 aa  42  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  25.34 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  26.35 
 
 		 189 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4308  protein of unknown function DUF820  23.4 
 
 		 184 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  33.76 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  28.15 
 
 		 188 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  30.83 
 
 		 186 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>