75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2158 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
186 aa  366  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  85.95 
 
 
189 aa  322  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  80 
 
 
185 aa  294  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3083  hypothetical protein  38.86 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439197  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  43.62 
 
 
187 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0075  protein of unknown function DUF820  39.04 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  41.21 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  36.76 
 
 
194 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0401  protein of unknown function DUF820  33.69 
 
 
200 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0392  protein of unknown function DUF820  33.69 
 
 
200 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1210  protein of unknown function DUF820  39.04 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2309  hypothetical protein  35.94 
 
 
191 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3149  hypothetical protein  34.22 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00139677  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0449  protein of unknown function DUF820  35.11 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391731  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0762  hypothetical protein  38.71 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000676574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  41.07 
 
 
210 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1423  protein of unknown function DUF820  33.7 
 
 
186 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  38.92 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0763  hypothetical protein  36.67 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.105804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1389  protein of unknown function DUF820  33.7 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  33.69 
 
 
186 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0222  protein of unknown function DUF820  40.57 
 
 
193 aa  104  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10891  normal  0.109063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3790  protein of unknown function DUF820  31.41 
 
 
190 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2203  protein of unknown function DUF820  39.04 
 
 
196 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.1814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4530  hypothetical protein  37.8 
 
 
162 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  37.11 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4739  protein of unknown function DUF820  35.2 
 
 
180 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0030  protein of unknown function DUF820  35.63 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1433  protein of unknown function DUF820  34.64 
 
 
180 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3738  protein of unknown function DUF820  29.32 
 
 
190 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2695  protein of unknown function DUF820  32.61 
 
 
181 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3408  protein of unknown function DUF820  32.61 
 
 
181 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.393779  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3231  hypothetical protein  33.99 
 
 
170 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2740  hypothetical protein  39.46 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  31.84 
 
 
186 aa  91.3  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1881  protein of unknown function DUF820  33.7 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1855  protein of unknown function DUF820  33.7 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4310  hypothetical protein  34.05 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1849  hypothetical protein  31.15 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3291  protein of unknown function DUF820  27.37 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.491293  normal  0.294877 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2809  protein of unknown function DUF820  27.37 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  33.54 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2204  protein of unknown function DUF820  41.24 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.171088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  30.07 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  37.61 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  34.71 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  36.44 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2118  protein of unknown function DUF820  34.13 
 
 
201 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  41.44 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  34.51 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  32.86 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  34.78 
 
 
226 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  35.76 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2906  hypothetical protein  29.2 
 
 
135 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0546574  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  29.2 
 
 
183 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  34.62 
 
 
184 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  31.43 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  31.69 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  27.4 
 
 
257 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  31.9 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  26.52 
 
 
182 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  28 
 
 
242 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  27.88 
 
 
245 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  30.1 
 
 
251 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  23.81 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  26.38 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1197  hypothetical protein  29.69 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  31.45 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  30.94 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  25.58 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  32.17 
 
 
186 aa  41.6  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  33.76 
 
 
210 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  30.71 
 
 
203 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  31.94 
 
 
201 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>