132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5079 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
214 aa  434  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  37.57 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  35.63 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  35.64 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  35.64 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  32.28 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  31.22 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  37.34 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  34.55 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  34.3 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3647  protein of unknown function DUF820  31.9 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0632204  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  35.9 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  29.48 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  35.9 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  31.03 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  36.69 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  30.54 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0094  hypothetical protein  33.73 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000049462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0863  protein of unknown function DUF820  33.55 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000768463  decreased coverage  0.000000790424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0721  protein of unknown function DUF820  32.95 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00402744  normal  0.197954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  33.57 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0693  protein of unknown function DUF820  33.14 
 
 
254 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  33.15 
 
 
201 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  27.88 
 
 
182 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  32.43 
 
 
253 aa  62  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3259  protein of unknown function DUF820  35.71 
 
 
242 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00168542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  34.85 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  29.56 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 
182 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  32.39 
 
 
187 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4511  protein of unknown function DUF820  29.56 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  31.43 
 
 
188 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  30.14 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  29.83 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  26.74 
 
 
197 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  34.59 
 
 
197 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  34.09 
 
 
203 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0820  protein of unknown function DUF820  28.48 
 
 
192 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0980811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  30.13 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  28.57 
 
 
187 aa  56.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  27.56 
 
 
181 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  32.28 
 
 
184 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  28.77 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  26.16 
 
 
191 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  30.57 
 
 
189 aa  55.1  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2162  hypothetical protein  30 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  31.54 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  28.79 
 
 
187 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  30.07 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  26.25 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  28.89 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0819  protein of unknown function DUF820  26.97 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0957178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  27.39 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  26.26 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2118  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  31.43 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1197  hypothetical protein  30.43 
 
 
191 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  32.17 
 
 
198 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  28.47 
 
 
191 aa  52  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  30.16 
 
 
206 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  30.37 
 
 
204 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  28.77 
 
 
189 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4202  hypothetical protein  44 
 
 
198 aa  51.6  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4366  protein of unknown function DUF820  30.82 
 
 
194 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  29.76 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  30.28 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  28.36 
 
 
153 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  27.16 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  30.41 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  32.47 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  29.38 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  29.37 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  27.93 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  28.77 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  34.35 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  32.06 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  27.74 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  30.41 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  29.09 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  28.26 
 
 
183 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  26.58 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1672  protein of unknown function DUF820  28.89 
 
 
240 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  32.81 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  30.12 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  28.75 
 
 
190 aa  48.5  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1187  protein of unknown function DUF820  25.52 
 
 
186 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  44.44 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  26.53 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  26.99 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3373  protein of unknown function DUF820  29.28 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0580  protein of unknown function DUF820  29.23 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2738  protein of unknown function DUF820  29.28 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  unclonable  0.00000000257493 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  31.11 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  26.27 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  29.32 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  29.41 
 
 
201 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  28.99 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0991  hypothetical protein  28.95 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0351934  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>