70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5162 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
197 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  49.75 
 
 
191 aa  185  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  52.88 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  46.19 
 
 
201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  49.48 
 
 
187 aa  158  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2118  protein of unknown function DUF820  48.94 
 
 
201 aa  148  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  45.45 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  43.32 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  35.36 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8443  protein of unknown function DUF820  40.56 
 
 
142 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0498606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  34.83 
 
 
219 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  33.53 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  31.18 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  35.21 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  28.98 
 
 
194 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  28.42 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  34.59 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  34.43 
 
 
186 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  34.85 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  36.44 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  36.44 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  36.44 
 
 
189 aa  55.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  30.07 
 
 
203 aa  55.1  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0763  hypothetical protein  29.69 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.105804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  29.61 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  29.69 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1210  protein of unknown function DUF820  34.59 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  28.74 
 
 
186 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4310  hypothetical protein  30.95 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0762  hypothetical protein  31.3 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000676574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  26.19 
 
 
257 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  31.03 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  31.29 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  30.21 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4739  protein of unknown function DUF820  26.87 
 
 
180 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  28.19 
 
 
202 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  31.93 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 
202 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  31.65 
 
 
197 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1672  protein of unknown function DUF820  29.06 
 
 
240 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158982 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3083  hypothetical protein  28.45 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3790  protein of unknown function DUF820  25.16 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0401  protein of unknown function DUF820  28.78 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  28.91 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0392  protein of unknown function DUF820  28.78 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1433  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
180 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  25.93 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  30.33 
 
 
204 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  30.65 
 
 
187 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  30.47 
 
 
198 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  31.68 
 
 
203 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3738  protein of unknown function DUF820  26.76 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2309  hypothetical protein  28.45 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  27.46 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3679  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
239 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  31.29 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  26.11 
 
 
200 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  25.29 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0222  protein of unknown function DUF820  28.29 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10891  normal  0.109063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1849  hypothetical protein  28.46 
 
 
188 aa  42  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  26.84 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  27.22 
 
 
225 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3259  protein of unknown function DUF820  36.36 
 
 
242 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00168542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  26.98 
 
 
203 aa  41.6  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  29.75 
 
 
215 aa  41.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  28.89 
 
 
223 aa  41.2  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  27.41 
 
 
205 aa  41.6  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1197  hypothetical protein  26.61 
 
 
191 aa  41.2  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>