52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8443 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8443  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
142 aa  287  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0498606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  54.74 
 
 
187 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  47.86 
 
 
224 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  50.76 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  44.2 
 
 
191 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  47.83 
 
 
201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2118  protein of unknown function DUF820  43.88 
 
 
201 aa  94  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  43.7 
 
 
226 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  40.56 
 
 
197 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  37.86 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  37.14 
 
 
184 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  30.56 
 
 
219 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  35.85 
 
 
210 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1423  protein of unknown function DUF820  32.38 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  29.46 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  38.33 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4310  hypothetical protein  34.62 
 
 
197 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0449  protein of unknown function DUF820  34.44 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391731  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  27.94 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  40.3 
 
 
210 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  35.37 
 
 
193 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  34.82 
 
 
289 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  28.3 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0392  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 
200 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0401  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 
200 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  39.02 
 
 
203 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  31.48 
 
 
257 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1849  hypothetical protein  32.61 
 
 
188 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  33.01 
 
 
191 aa  43.9  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  38.68 
 
 
204 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0763  hypothetical protein  31.37 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.105804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  31.65 
 
 
186 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  29.11 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  32.29 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  31.31 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  36.49 
 
 
203 aa  42  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  34.02 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1389  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
186 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  40 
 
 
319 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4739  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
180 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  35.71 
 
 
194 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  42.25 
 
 
350 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1210  protein of unknown function DUF820  38.75 
 
 
189 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3790  protein of unknown function DUF820  27.93 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  30.56 
 
 
190 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  42.25 
 
 
376 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  30.97 
 
 
202 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0762  hypothetical protein  30.3 
 
 
187 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000676574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  36.78 
 
 
205 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  37.93 
 
 
205 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  41.79 
 
 
340 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
225 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>