17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1672 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1672  protein of unknown function DUF820  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158982 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  37.13 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  31.16 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  31.66 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  28.89 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1348  hypothetical protein  38.75 
 
 		 124 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0417426  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  27.32 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  29.06 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  26.7 
 
 		 203 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  26.92 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  22.89 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  28.99 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  24.03 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  29.73 
 
 		 188 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2628  protein of unknown function DUF820  25.83 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3475  protein of unknown function DUF820  25.83 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  26.83 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>