58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3390 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3390  response regulator receiver protein  100 
 
 		 197 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  43.17 
 
 		 189 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  37.7 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  33.87 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  32.45 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  27.98 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  25.68 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  26.63 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  31.95 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  32.28 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  32.09 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  26.63 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  31.61 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  30.17 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  30.16 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  29.03 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  36.23 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  27.93 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  26.97 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  31.87 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  29.03 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  25.73 
 
 		 253 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  25.6 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  35.46 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  27.47 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  22.7 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  30 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  30 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  29.41 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  37.25 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  25.41 
 
 		 245 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  25.95 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  25.65 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  31.61 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  29.17 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  28.49 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  23.68 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  26.16 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  26.04 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  29.57 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  22.63 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  25.15 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0099  protein of unknown function DUF820  26.53 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  24.59 
 
 		 241 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  26.32 
 
 		 187 aa  44.7  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  29.75 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  23.16 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0094  hypothetical protein  25.15 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000049462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  33.55 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  24.17 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1187  protein of unknown function DUF820  24.36 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4511  protein of unknown function DUF820  35.44 
 
 		 195 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  35.44 
 
 		 195 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  24.32 
 
 		 242 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3948  hypothetical protein  29.29 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0198383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>