171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3458 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  78.74 
 
 
207 aa  325  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  52.17 
 
 
218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  53.16 
 
 
203 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  54.74 
 
 
203 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  52.63 
 
 
203 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  51.58 
 
 
203 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  49.47 
 
 
206 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  53.52 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  45.45 
 
 
202 aa  141  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  45.51 
 
 
201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  41.95 
 
 
203 aa  131  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  46.41 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  41 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  40.5 
 
 
197 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  40.5 
 
 
197 aa  118  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  41.85 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  33.9 
 
 
187 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  36.43 
 
 
182 aa  101  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  32.78 
 
 
183 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  36.81 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  34.44 
 
 
188 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  36.62 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  37.91 
 
 
189 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  34.08 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  32.57 
 
 
184 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  32.78 
 
 
257 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  36.22 
 
 
180 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  35 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  29.17 
 
 
193 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  28.8 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  36.07 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  32.2 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  38.96 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  32.24 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  32.39 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  29.9 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  37.41 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  29.71 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  32 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  32.84 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  31.58 
 
 
200 aa  72  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  29.89 
 
 
191 aa  72  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  24.73 
 
 
193 aa  72  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  31.4 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  29.55 
 
 
191 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  32.5 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  31.4 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  30.87 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  30.69 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  26.16 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  30.2 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  32.74 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  28.85 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  31.74 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3390  response regulator receiver protein  32.28 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  25 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  30.41 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  28.16 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  29.61 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  36.55 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  23.78 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  35.86 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  25.14 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  31.91 
 
 
207 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  27.12 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  28.18 
 
 
193 aa  62.4  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  29.61 
 
 
205 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  30.29 
 
 
204 aa  62  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  29.38 
 
 
241 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  27.87 
 
 
257 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  26.55 
 
 
245 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  29.71 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  25.32 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  29.81 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  30.25 
 
 
194 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  26.98 
 
 
192 aa  58.9  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  25.73 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  26.53 
 
 
223 aa  58.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  29.85 
 
 
215 aa  58.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  27.16 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  34.72 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  36.59 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  26.74 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  34.03 
 
 
184 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  32.9 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  29.41 
 
 
242 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  29.14 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  26.75 
 
 
187 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  32 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  28.74 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  29.95 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  25.68 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3948  hypothetical protein  28.67 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  28.48 
 
 
193 aa  52  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2162  hypothetical protein  30.95 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  29.05 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>