195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2505 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  377  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  43.78 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  41.44 
 
 
184 aa  140  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  42.86 
 
 
184 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  39.78 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  37.5 
 
 
213 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  31.84 
 
 
191 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0099  protein of unknown function DUF820  39.04 
 
 
194 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1833  hypothetical protein  38.38 
 
 
185 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  36 
 
 
193 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0734  protein of unknown function DUF820  33.69 
 
 
185 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  30.73 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2886  protein of unknown function DUF820  29.75 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2463  protein of unknown function DUF820  32.9 
 
 
185 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2406  protein of unknown function DUF820  31.61 
 
 
185 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0713  protein of unknown function DUF820  32.48 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.277122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  37.8 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4017  protein of unknown function DUF820  28.09 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.389998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1895  protein of unknown function DUF820  29.56 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1919  protein of unknown function DUF820  29.56 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2366  protein of unknown function DUF820  27.5 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2128  hypothetical protein  28.48 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2023  protein of unknown function DUF820  29.71 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2049  protein of unknown function DUF820  29.71 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1790  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1209  protein of unknown function DUF820  29.19 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1440  protein of unknown function DUF820  27.67 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0341  protein of unknown function DUF820  31.61 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000574884  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4387  hypothetical protein  30.06 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5097  protein of unknown function DUF820  33.52 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0100  hypothetical protein  29.41 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637727  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1238  protein of unknown function DUF820  30.3 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  27.13 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5150  protein of unknown function DUF820  30.32 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3416  protein of unknown function DUF820  26.79 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1761  protein of unknown function DUF820  28.87 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2985  protein of unknown function DUF820  29.17 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  31.46 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1268  protein of unknown function DUF820  28.87 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  hitchhiker  0.00936719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2465  protein of unknown function DUF820  29.76 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2428  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3326  hypothetical protein  29.11 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.138444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2017  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2042  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000371183  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2170  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1789  protein of unknown function DUF820  28.35 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0815635  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0963  protein of unknown function DUF820  28.93 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000104175  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2598  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.855565  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3644  protein of unknown function DUF820  29.17 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1060  hypothetical protein  30.18 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000122836  decreased coverage  0.00000222645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2794  protein of unknown function DUF820  27.74 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274491  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2387  protein of unknown function DUF820  25.97 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3323  protein of unknown function DUF820  27.74 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2438  protein of unknown function DUF820  25.97 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.873691  normal  0.192917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1028  protein of unknown function DUF820  26.06 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0468  protein of unknown function DUF820  28.93 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0619139  normal  0.13059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5071  protein of unknown function DUF820  33.77 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0999  protein of unknown function DUF820  25.45 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0074  protein of unknown function DUF820  27.5 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.716542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0076  protein of unknown function DUF820  27.5 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4062  hypothetical protein  24.02 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.654583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3948  hypothetical protein  28.34 
 
 
204 aa  61.6  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4048  hypothetical protein  37.5 
 
 
123 aa  61.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726239  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  25.93 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  29.78 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3655  protein of unknown function DUF820  23.89 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1566  hypothetical protein  30.71 
 
 
161 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  22.91 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  31.29 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  27.91 
 
 
223 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0891  protein of unknown function DUF820  28.29 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1493  protein of unknown function DUF820  28.19 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000252154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3227  protein of unknown function DUF820  25.58 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  27.07 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2896  protein of unknown function DUF820  27.13 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.627457  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  28 
 
 
203 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0102  hypothetical protein  27.59 
 
 
187 aa  58.5  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0643  hypothetical protein  25.97 
 
 
192 aa  57.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263684  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1596  protein of unknown function DUF820  26.29 
 
 
194 aa  57.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  25.87 
 
 
182 aa  57.8  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3773  hypothetical protein  28.3 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211833  normal  0.137828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3926  hypothetical protein  24.44 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746975  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0267  protein of unknown function DUF820  25.43 
 
 
200 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3010  protein of unknown function DUF820  25.79 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  30.32 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0572  protein of unknown function DUF820  26.42 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3284  protein of unknown function DUF820  26.74 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000638939  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2815  protein of unknown function DUF820  26.74 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  29.61 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1187  protein of unknown function DUF820  27.4 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5248  protein of unknown function DUF820  29 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.73684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0267  protein of unknown function DUF820  25.43 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1609  protein of unknown function DUF820  28.92 
 
 
199 aa  55.5  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  28.22 
 
 
188 aa  55.1  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3494  protein of unknown function DUF820  26.4 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  28.74 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4918  protein of unknown function DUF820  29.27 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417991 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1350  protein of unknown function DUF820  26.63 
 
 
178 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.946881  hitchhiker  0.0000000359977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1321  protein of unknown function DUF820  26.63 
 
 
178 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>