More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0357 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 308 aa  633  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  59.53 
 
 		 302 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  34.07 
 
 		 306 aa  89.4  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  28.75 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  32.14 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  28.8 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  28.97 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  28.25 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  24.52 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  25.71 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  25.08 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  27.94 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  28.67 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  27.8 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  27.83 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  27.07 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  26.2 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  27.3 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  26.42 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  26.28 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  25.5 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  23.89 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  35.78 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  26.04 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  25.99 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  25.09 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.38 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  24.48 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  24.9 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  22.91 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  24.06 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  26.01 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  22.45 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  35.77 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1424  PfkB domain protein  26.83 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  27.09 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.91 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  25.27 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  25.35 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  40.48 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  26.22 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  32.5 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  23.86 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  30.08 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  30.08 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  21.05 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  26.47 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  24.44 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  26.37 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  24.75 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  23.53 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  22.78 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  24.9 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  24.04 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  24.22 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  26.09 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  26.03 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  24.22 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  25 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0398  ribokinase-like domain-containing protein  24.91 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.688788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  23.83 
 
 		 404 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  25.28 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  22.38 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  26.62 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  23.74 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  23.74 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  26.47 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.5 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  23.74 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  37.21 
 
 		 342 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  24.62 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  23.66 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  27.64 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  38.37 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  27.57 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  23.88 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  24.65 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  24.28 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  27.86 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2948  ribokinase-like domain-containing protein  26.81 
 
 		 283 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64332 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  27.86 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  28.35 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  37.36 
 
 		 316 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  24.42 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  37.36 
 
 		 316 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1516  putative regulatory protein  30.15 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115936  hitchhiker  0.000000147446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  25.51 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1479  putative regulatory protein DeoR family  30.15 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.255884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  28.69 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1495  putative regulatory protein  30.15 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.943692  hitchhiker  0.0000000000000150767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  23.88 
 
 		 424 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1960  putative regulatory protein  30.15 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000520335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1789  putative regulatory protein, DeoR family  30.15 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  24.32 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  34.51 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  23.35 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  24.44 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>