More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0985 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  100 
 
 		 406 aa  831    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  94.44 
 
 		 396 aa  774    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  94.44 
 
 		 396 aa  773    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  76.39 
 
 		 404 aa  618  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  76.5 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  67.77 
 
 		 417 aa  547  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  66.23 
 
 		 393 aa  541  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  66.23 
 
 		 393 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  64.32 
 
 		 398 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  66.23 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  65.71 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  66.23 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 398 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  65.45 
 
 		 393 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  64.07 
 
 		 398 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  64.68 
 
 		 393 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  66.23 
 
 		 393 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  66.23 
 
 		 393 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  66.23 
 
 		 393 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  66.23 
 
 		 393 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  66.23 
 
 		 393 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  66.23 
 
 		 393 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 407 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 406 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  54.69 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  54.62 
 
 		 406 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  49.26 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  53.4 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  51.8 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  51.78 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  51.71 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  46.68 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  43.64 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  46.49 
 
 		 401 aa  349  6e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  46.74 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 405 aa  336  3.9999999999999995e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  43.33 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 		 400 aa  328  9e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 393 aa  322  7e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  42.45 
 
 		 397 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  45.55 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 388 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 397 aa  319  7e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  41.16 
 
 		 386 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  41.4 
 
 		 405 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 408 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  38.76 
 
 		 395 aa  309  6.999999999999999e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  41.07 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  44.88 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 410 aa  306  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  40.95 
 
 		 410 aa  306  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  40.95 
 
 		 410 aa  305  9.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  40.05 
 
 		 433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  40.15 
 
 		 433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  42.11 
 
 		 404 aa  302  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  39.03 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  40.5 
 
 		 406 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  41.84 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  40.56 
 
 		 611 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  46.03 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  39.01 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 416 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  39.64 
 
 		 436 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  40.56 
 
 		 441 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  37.09 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  41.31 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  38.73 
 
 		 435 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 397 aa  293  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 399 aa  293  6e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 391 aa  292  7e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  42.38 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 441 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  42.38 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  38.92 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 413 aa  289  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  40.77 
 
 		 397 aa  289  6e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 438 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  43.92 
 
 		 402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  40.3 
 
 		 400 aa  285  8e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 414 aa  285  9e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>