More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0231 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0231  putative (homoserine/homoserine lactone) efflux transmembrane protein  100 
 
 		 211 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  86.45 
 
 		 215 aa  332  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  85.05 
 
 		 215 aa  328  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  73.21 
 
 		 207 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  73.68 
 
 		 207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  73.21 
 
 		 207 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  73.21 
 
 		 207 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  73.21 
 
 		 207 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  73.21 
 
 		 207 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  73.21 
 
 		 207 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  72.73 
 
 		 207 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  57.35 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  51.2 
 
 		 211 aa  211  9e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  52.13 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  46.19 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.5 
 
 		 211 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48 
 
 		 211 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  45.45 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  48.02 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  53.01 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.28 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.85 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  31.16 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5434  lysine exporter protein LysE/YggA  43.05 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.96 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.07 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  35.51 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  40.12 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  40.12 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  40.12 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.85 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0202  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.26 
 
 		 159 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  39.55 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  40.12 
 
 		 242 aa  98.2  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 211 aa  97.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  38.95 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.23 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.65 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  37.84 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7111  RhtB family transporter  33.33 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.57 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  39.29 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  31.68 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.41 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  33.82 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4624  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.629112  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37.78 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.48 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  36.54 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.54 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  36.54 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  30.35 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  35.78 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.78 
 
 		 216 aa  91.3  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.7 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  36.54 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  36.54 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  36.54 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  36.54 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.12 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.39 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.95 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.49 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  38.41 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  29 
 
 		 203 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.49 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  37.8 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.46 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.84 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  32.2 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  36.69 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3381  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 209 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>