More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0351 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 354 aa  706    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  99.12 
 
 		 341 aa  675    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  89.44 
 
 		 341 aa  614  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  68.04 
 
 		 340 aa  474  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  47.69 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  47.4 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  48.55 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  46.48 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  51.22 
 
 		 329 aa  298  7e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  45.3 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  49.7 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.35 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  48.18 
 
 		 323 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  47.72 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  46.06 
 
 		 338 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  44.14 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43.45 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.33 
 
 		 339 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.2 
 
 		 323 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.41 
 
 		 339 aa  258  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  48.5 
 
 		 334 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  48.17 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.07 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  41.76 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.32 
 
 		 352 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.6 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  45.02 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  45.54 
 
 		 346 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  46.71 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  45.99 
 
 		 314 aa  242  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  42.07 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  42.15 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  41.27 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  40.61 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  40.91 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.61 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.41 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  45.57 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  43.94 
 
 		 339 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  43.94 
 
 		 339 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.61 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.61 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.61 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  42.91 
 
 		 322 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.03 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.03 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.42 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  46.22 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.33 
 
 		 339 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  46.5 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.67 
 
 		 321 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.27 
 
 		 313 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  48.45 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.87 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  40 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.97 
 
 		 373 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.77 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  41.12 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.38 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  36.34 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  35.19 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  35.12 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  30.98 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  32.94 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  34.33 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  33.63 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  32.75 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.56 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  28.53 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.21 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  26.38 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  30.37 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  30.98 
 
 		 309 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  29.18 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  28.05 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  29.15 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  30.63 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  28.73 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  27.86 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  27.15 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  25.67 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  27.35 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.49 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  28.13 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  29.29 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.36 
 
 		 311 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  27.73 
 
 		 329 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  27.33 
 
 		 311 aa  92.8  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.36 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.36 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.36 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  27.43 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  28.36 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  25.36 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  25.23 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  25.45 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  28.37 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  28.82 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>