More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3656 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3656  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 694 aa  1391    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1361  AAA ATPase, central region  45.02 
 
 		 704 aa  511  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0020  AAA ATPase, central region  43.68 
 
 		 697 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  32.13 
 
 		 699 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  31.67 
 
 		 625 aa  198  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1816  ATPase central domain-containing protein  30.57 
 
 		 590 aa  194  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1202  ATPase central domain-containing protein  31.48 
 
 		 627 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0870142  normal  0.869838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4675  ATPase central domain-containing protein  31.97 
 
 		 720 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  30.55 
 
 		 683 aa  171  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.75 
 
 		 602 aa  163  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0194  AAA ATPase central domain protein  33.18 
 
 		 619 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  32.51 
 
 		 715 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0808  ATPase central domain-containing protein  32.46 
 
 		 715 aa  158  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  32.72 
 
 		 715 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.08 
 
 		 610 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.08 
 
 		 610 aa  154  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.86 
 
 		 662 aa  152  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.4 
 
 		 608 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.56 
 
 		 639 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.22 
 
 		 713 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.9 
 
 		 646 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.22 
 
 		 717 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.21 
 
 		 697 aa  146  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.9 
 
 		 679 aa  146  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.21 
 
 		 697 aa  146  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2062  vesicle-fusing ATPase  32.31 
 
 		 617 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139839  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  30.4 
 
 		 753 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.64 
 
 		 743 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  28.71 
 
 		 708 aa  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  31.81 
 
 		 630 aa  145  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.47 
 
 		 644 aa  144  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.16 
 
 		 615 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.89 
 
 		 705 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  32.28 
 
 		 693 aa  143  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.16 
 
 		 608 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  32.13 
 
 		 702 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0625  Vesicle-fusing ATPase  31.02 
 
 		 500 aa  143  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.68 
 
 		 607 aa  143  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.65 
 
 		 706 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  29.34 
 
 		 682 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  32.98 
 
 		 615 aa  142  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.34 
 
 		 632 aa  142  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  30.23 
 
 		 623 aa  141  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.34 
 
 		 635 aa  142  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.79 
 
 		 624 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  32.22 
 
 		 627 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.21 
 
 		 687 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  33.15 
 
 		 627 aa  140  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.65 
 
 		 645 aa  140  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  27.92 
 
 		 700 aa  139  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  29.29 
 
 		 632 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.09 
 
 		 696 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  30.39 
 
 		 917 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.16 
 
 		 753 aa  140  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  31.3 
 
 		 645 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  32.25 
 
 		 605 aa  139  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.04 
 
 		 623 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.58 
 
 		 672 aa  140  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.9 
 
 		 601 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.9 
 
 		 601 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.15 
 
 		 618 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.33 
 
 		 633 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  31.49 
 
 		 654 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  27.56 
 
 		 633 aa  140  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.03 
 
 		 697 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  31.84 
 
 		 635 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.39 
 
 		 666 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.18 
 
 		 625 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.09 
 
 		 714 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  31.29 
 
 		 656 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.48 
 
 		 639 aa  139  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.47 
 
 		 616 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.73 
 
 		 681 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  32.01 
 
 		 615 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.21 
 
 		 620 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.28 
 
 		 647 aa  139  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  27.38 
 
 		 619 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.39 
 
 		 666 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.39 
 
 		 666 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.75 
 
 		 669 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.15 
 
 		 618 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.39 
 
 		 666 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  33.15 
 
 		 621 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.39 
 
 		 666 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.25 
 
 		 605 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  27.85 
 
 		 697 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.67 
 
 		 651 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.39 
 
 		 852 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.91 
 
 		 611 aa  138  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  31.51 
 
 		 646 aa  138  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.47 
 
 		 793 aa  138  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.3 
 
 		 617 aa  138  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.95 
 
 		 671 aa  138  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.39 
 
 		 662 aa  138  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  27.79 
 
 		 633 aa  138  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.16 
 
 		 798 aa  138  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.8 
 
 		 656 aa  138  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.22 
 
 		 614 aa  137  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.58 
 
 		 599 aa  137  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  31.3 
 
 		 692 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>