80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4371 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  90.26 
 
 		 154 aa  255  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  87.66 
 
 		 154 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  69.86 
 
 		 157 aa  216  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  54.05 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  50.68 
 
 		 156 aa  140  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  45.1 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  40.14 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  43.33 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  45.77 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  39.6 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  42.95 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  42.18 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  50.44 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  45.21 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  42.11 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  46.22 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  35.97 
 
 		 280 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  45.89 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  42.04 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  39.6 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  43.31 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  87  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  42.52 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  45.67 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  38.36 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  35.82 
 
 		 264 aa  83.6  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  34.69 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  38.74 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  41.35 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  37.98 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  34.68 
 
 		 272 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  37.24 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  37.24 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  35.86 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  30.32 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  37.1 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  31.55 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  33.97 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  37.07 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  35.34 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  35.71 
 
 		 283 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  34.31 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  37.07 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  36.61 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  34.78 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  37.27 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  36 
 
 		 269 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  37.72 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  34.31 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  35.92 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  35 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  35.92 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  36.84 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  31.25 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  32.85 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  34.95 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  32.21 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  31.25 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  36.89 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  28.86 
 
 		 278 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  31.45 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  30 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  30 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  26.95 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  30 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  30.72 
 
 		 258 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  33.86 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  30.77 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  33.86 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  30.58 
 
 		 271 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  28.47 
 
 		 280 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  31.31 
 
 		 290 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  30.61 
 
 		 256 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  27.72 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  26.53 
 
 		 281 aa  44.3  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  28.28 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  31.31 
 
 		 266 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  29.9 
 
 		 256 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>