More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4110 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 626 aa  1269    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  51.37 
 
 		 624 aa  614  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  51.44 
 
 		 642 aa  600  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  42.41 
 
 		 652 aa  452  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  39.69 
 
 		 606 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  40.72 
 
 		 612 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  45.06 
 
 		 512 aa  395  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 		 664 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  45.12 
 
 		 476 aa  360  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 		 848 aa  350  4e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  41.14 
 
 		 475 aa  345  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  44.94 
 
 		 464 aa  345  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  44.94 
 
 		 464 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  44.66 
 
 		 417 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 		 654 aa  331  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 		 686 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  44.59 
 
 		 614 aa  317  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 		 616 aa  316  8e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.1 
 
 		 532 aa  313  4.999999999999999e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.66 
 
 		 573 aa  313  6.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  44.85 
 
 		 596 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  33.66 
 
 		 698 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.48 
 
 		 630 aa  310  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  44.84 
 
 		 636 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  44.84 
 
 		 604 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  34.71 
 
 		 664 aa  309  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  41.36 
 
 		 632 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  41.88 
 
 		 626 aa  306  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  35.88 
 
 		 635 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  43.54 
 
 		 678 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  34.09 
 
 		 628 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  43.67 
 
 		 673 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  39.15 
 
 		 678 aa  302  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 		 537 aa  301  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  46.58 
 
 		 656 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.53 
 
 		 656 aa  294  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 		 615 aa  290  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 		 650 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 		 509 aa  275  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  41.9 
 
 		 683 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  37.59 
 
 		 492 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  47.98 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  45.66 
 
 		 465 aa  157  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  42.57 
 
 		 219 aa  153  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  43.28 
 
 		 216 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 		 433 aa  135  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  29.02 
 
 		 433 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  29.14 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  29.14 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  29.43 
 
 		 433 aa  132  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  29.14 
 
 		 433 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  29.14 
 
 		 433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 461 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 		 393 aa  104  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 		 549 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 471 aa  97.4  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 395 aa  95.1  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  25.64 
 
 		 1154 aa  95.1  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 505 aa  94.4  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.68 
 
 		 644 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 509 aa  90.9  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 		 483 aa  90.1  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 		 399 aa  87.8  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 		 533 aa  87  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 546 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.8 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18681  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 433 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  26.8 
 
 		 520 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  26.55 
 
 		 633 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18491  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.468741  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  24.9 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  27.06 
 
 		 662 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 508 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1751  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121941  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 		 752 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 		 494 aa  80.1  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5087  N-acetylglucosaminyltransferase, N-terminus (glycosyl transferase)  27.96 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  25.31 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  28.52 
 
 		 439 aa  77  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5599  N-acetylglucosaminyltransferase  27.52 
 
 		 262 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  hitchhiker  0.0000000000128208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  25.73 
 
 		 469 aa  77  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0197  glycosyl transferase family 2  26 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 		 502 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>