More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0301 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  95.74 
 
 		 142 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  87.86 
 
 		 140 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  80 
 
 		 142 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  63.57 
 
 		 141 aa  196  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  65 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  60.28 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  61.43 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  61.03 
 
 		 141 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  55.71 
 
 		 141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  63.2 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  42.76 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  43.15 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  40.41 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  39.73 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  40.43 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  40.14 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  39.01 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  40.43 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  42.4 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  37.31 
 
 		 131 aa  99  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  40.6 
 
 		 131 aa  97.1  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  39.04 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  41.13 
 
 		 137 aa  95.5  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  39.16 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  40.15 
 
 		 132 aa  94.7  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  38.35 
 
 		 138 aa  94  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  35.77 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  35.61 
 
 		 136 aa  93.6  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  39.52 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  38.35 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  39.84 
 
 		 133 aa  90.9  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  39.55 
 
 		 139 aa  90.9  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  41.18 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  41.18 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  38.4 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  36.84 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  38.97 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39455  predicted protein  33.53 
 
 		 244 aa  88.2  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  35.07 
 
 		 137 aa  87.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  38.81 
 
 		 130 aa  87.4  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  36.75 
 
 		 133 aa  87.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  39.02 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  37.5 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  38.06 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  38.1 
 
 		 133 aa  86.3  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  36.51 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  37.3 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  37.12 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  34.11 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  35.11 
 
 		 133 aa  85.1  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  34.59 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  35.94 
 
 		 136 aa  85.1  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  35.46 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  30.71 
 
 		 137 aa  84.3  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  35.04 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  35.04 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  38.64 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  35.71 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05951  hypothetical protein  34.53 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.517381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  35.9 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  36.43 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  35.2 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  34.92 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 		 584 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  34.29 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  34.27 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  34.27 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  30.67 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  33.59 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  36.43 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  33.57 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  32.09 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  35.25 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  34.13 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  33.57 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  38.4 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  34.29 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  35.97 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  36.51 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  35.71 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  39.66 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  34.15 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  34.53 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  32.17 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  32.17 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  36.22 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  33.57 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  34.4 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  34.13 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  38.69 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  38.93 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  32.52 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  36.51 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>