102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0201 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0201  camphor resistance CrcB protein  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1527  Camphor resistance CrcB protein  74.83 
 
 		 147 aa  221  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  40.8 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  39.34 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  45.45 
 
 		 270 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  35.43 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  40.17 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  39.76 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  32.77 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  38.64 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  36.72 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  35.94 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  30.66 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  30 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  36.26 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  31.36 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  31.34 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  29.41 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  32.5 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  33.67 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  27.48 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  32.46 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  32.74 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  32 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  27.82 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  32.63 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  33.61 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  32.2 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  28.33 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  28.57 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  31.09 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37.18 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37.18 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  32.17 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  32.2 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  27.07 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  27.07 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  30.25 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  37.74 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  32.53 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  31.3 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  31.71 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  28 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  27.07 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  34.58 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  34.58 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  33.82 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  29.66 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  32.05 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  29.51 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  30.43 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  31.18 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  32.38 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  29.2 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  28.57 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  34.04 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  29.25 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  32.05 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  30.51 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  30.58 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  37.08 
 
 		 127 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  35.59 
 
 		 124 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1306  CrcB protein  34.95 
 
 		 127 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5115  Camphor resistance CrcB protein  31.78 
 
 		 127 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  25.71 
 
 		 144 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1468  CrcB protein  34.95 
 
 		 127 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  26.52 
 
 		 144 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3282  Camphor resistance CrcB protein  32.58 
 
 		 129 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  27.2 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  28.57 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  32.71 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  26.55 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  31.58 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  30.83 
 
 		 124 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  38.55 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  29.17 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  32.23 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  30.83 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  30.53 
 
 		 122 aa  41.2  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  33.62 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>