183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3334 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  265  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  91.85 
 
 		 135 aa  249  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  76.52 
 
 		 146 aa  204  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  75.42 
 
 		 121 aa  182  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  68.6 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  68.1 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  68.1 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  68.1 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  68.6 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  68.1 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  68.1 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  68.1 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  68.1 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  67.44 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  67.44 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  67.77 
 
 		 132 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  66.12 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  73.55 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  65.67 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  65.67 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  60.9 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  61.65 
 
 		 135 aa  163  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  66.94 
 
 		 134 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  66.94 
 
 		 134 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  63.7 
 
 		 135 aa  160  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  65.62 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  62.41 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  62.41 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  59.4 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  61.65 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  58.96 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  65.89 
 
 		 134 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  63.16 
 
 		 135 aa  154  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  60.9 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  66.94 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  64.84 
 
 		 134 aa  153  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  64.66 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  60.15 
 
 		 141 aa  150  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70650  putative GlcG protein  66.92 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  59.4 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  61.65 
 
 		 135 aa  147  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  58.65 
 
 		 135 aa  147  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  65.67 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0174781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  56.39 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  54.55 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  53.38 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  54.62 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2281  hypothetical protein  60.9 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134622  normal  0.0127263 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  54.55 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  54.55 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  54.55 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  54.55 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  54.55 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  54.55 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  54.55 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  56.92 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3055  hypothetical protein  55.64 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  52.89 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  58.88 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  58.82 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  46.21 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  40.91 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  51 
 
 		 158 aa  103  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  40.6 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  42.75 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  38.17 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  42.86 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  37.04 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  37.04 
 
 		 181 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  41.24 
 
 		 175 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  41.82 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  33.59 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  36.51 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  38.24 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  45.13 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  41.67 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  35.71 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  40.83 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  33.58 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  38.28 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  44.23 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  44.23 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  38.76 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  39.13 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  46.23 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  35.61 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  36.84 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1827  hypothetical protein  39.44 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  34.86 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  36.75 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  36.15 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  32.12 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  37.29 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  38.14 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  39.13 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  29.41 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  32.58 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>