126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3129 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3129  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  100 
 
 		 287 aa  594  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3299  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  92.25 
 
 		 258 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.242823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  49.29 
 
 		 300 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  51.1 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  50.74 
 
 		 295 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  49.64 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  50.74 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  48.23 
 
 		 300 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  48.06 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  49.81 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2396  alpha/beta hydrolase fold protein  45.59 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1647  rhamnosyltransferase chain A  48.6 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  48.53 
 
 		 295 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3271  alpha/beta hydrolase  48.28 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5097  alpha/beta hydrolase  48.28 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  47.89 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  47.89 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5185  alpha/beta hydrolase  48.28 
 
 		 300 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0312976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0556  Alpha/beta hydrolase  48.45 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4509  alpha/beta hydrolase fold  48.06 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5034  alpha/beta hydrolase fold  48.06 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  47.89 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  47.89 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  47.89 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  47.89 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  47.89 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  47.89 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  47.51 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  47.51 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  47.51 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  47.51 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.79 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.79 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.79 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.79 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3982  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  45.39 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4248  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  45.99 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  43.54 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2287  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  37.93 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.19 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  21.71 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1643  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  25.09 
 
 		 462 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  23.11 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  21.48 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  21.31 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  21.13 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  24.9 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  25.58 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  20.83 
 
 		 267 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 		 291 aa  48.9  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  29.01 
 
 		 294 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  25.78 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  21.26 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 345 aa  47  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  26.71 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  22.18 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0318  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  23.47 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  23.13 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  21.4 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  26.71 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  26.71 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  19.46 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  19.49 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  22.17 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  22.69 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1644  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  21.62 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  25.34 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  26.9 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  25.95 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  25.95 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  20.82 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  20.69 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  21.93 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  20.73 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  21.93 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  21.46 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  19.93 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  21.94 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.04 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  18.99 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  32.47 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>