More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3101 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  91.87 
 
 		 332 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 332 aa  690    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  75.56 
 
 		 335 aa  514  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  70.64 
 
 		 341 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  71.61 
 
 		 332 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  68.88 
 
 		 332 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  73.05 
 
 		 332 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  73.38 
 
 		 332 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  68.81 
 
 		 350 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  65.54 
 
 		 377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  66.77 
 
 		 353 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  63.27 
 
 		 333 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  64.26 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  65.91 
 
 		 406 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  65.91 
 
 		 877 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  66.02 
 
 		 387 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  65.59 
 
 		 353 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  65.59 
 
 		 353 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  62.35 
 
 		 333 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  65.92 
 
 		 353 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  65.27 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  65.58 
 
 		 344 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  65.91 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  65.91 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  65.91 
 
 		 404 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  65.91 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  64.61 
 
 		 387 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  65.69 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  65.81 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  65.81 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  62.26 
 
 		 341 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  62.01 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  61.44 
 
 		 348 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  60.78 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  57.45 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  57.75 
 
 		 331 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  52.43 
 
 		 381 aa  336  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  48.01 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  55.15 
 
 		 344 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  55.48 
 
 		 344 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  52.12 
 
 		 333 aa  331  9e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  54.15 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  50.33 
 
 		 333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  49.34 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  53.16 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  44.89 
 
 		 329 aa  287  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  46.69 
 
 		 346 aa  261  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 		 330 aa  245  9e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 336 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  38.62 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  35.18 
 
 		 343 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.35 
 
 		 276 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  25.18 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  29.14 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  27.7 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  27.23 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.68 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.23 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  27.23 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  32.48 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  34.55 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  27.23 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.62 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  27.23 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  27.23 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  22.18 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  27.23 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  24.41 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.2 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.29 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>