More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3962 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  99.4 
 
 		 497 aa  1011    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  80.08 
 
 		 498 aa  820    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  80.48 
 
 		 498 aa  816    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  92.76 
 
 		 497 aa  959    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  83.23 
 
 		 496 aa  857    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  75.81 
 
 		 544 aa  793    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  83.7 
 
 		 504 aa  874    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  79.47 
 
 		 494 aa  810    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  75.81 
 
 		 496 aa  792    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  97.18 
 
 		 497 aa  994    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  1019    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  60.32 
 
 		 495 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  57.4 
 
 		 492 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  56.11 
 
 		 501 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  55.31 
 
 		 497 aa  558  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  55.98 
 
 		 521 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  49.2 
 
 		 497 aa  478  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  48.39 
 
 		 493 aa  480  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.01 
 
 		 534 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  47.97 
 
 		 491 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.85 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  45.92 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  48.19 
 
 		 496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  45.77 
 
 		 495 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  42.37 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  43.2 
 
 		 494 aa  402  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  40.44 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  40.78 
 
 		 490 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  40.44 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  40.45 
 
 		 486 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  39.43 
 
 		 496 aa  360  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  37.62 
 
 		 532 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  37.75 
 
 		 549 aa  355  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  38.68 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  37.76 
 
 		 535 aa  353  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.24 
 
 		 502 aa  348  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  38.4 
 
 		 556 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  35.47 
 
 		 498 aa  323  5e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  37.83 
 
 		 556 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.31 
 
 		 551 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  35.16 
 
 		 549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  34.43 
 
 		 578 aa  310  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  34.06 
 
 		 492 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  33.48 
 
 		 474 aa  271  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  52.61 
 
 		 609 aa  250  4e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  52.36 
 
 		 288 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.63 
 
 		 267 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.21 
 
 		 267 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  48.13 
 
 		 270 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  47.3 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  47.3 
 
 		 270 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  46.89 
 
 		 270 aa  232  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  46.89 
 
 		 270 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  46.89 
 
 		 270 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  46.89 
 
 		 254 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  46.89 
 
 		 254 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  48.76 
 
 		 259 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  46.91 
 
 		 308 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  46.41 
 
 		 270 aa  223  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  45.23 
 
 		 258 aa  209  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  46.64 
 
 		 264 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  46.79 
 
 		 261 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  45.45 
 
 		 263 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  44.5 
 
 		 279 aa  193  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  43.38 
 
 		 307 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  39.74 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  37.45 
 
 		 289 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  37.05 
 
 		 262 aa  176  9e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  40.68 
 
 		 299 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  43.16 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  39.33 
 
 		 322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  41.01 
 
 		 303 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  39.81 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  35.94 
 
 		 367 aa  172  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  37.82 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3677  hypothetical protein  41.2 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  34.63 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  37.44 
 
 		 263 aa  171  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  40.65 
 
 		 337 aa  171  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  37.31 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  39.55 
 
 		 328 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0297  hypothetical protein  40.42 
 
 		 319 aa  170  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  37.28 
 
 		 256 aa  170  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0310  hypothetical protein  40.42 
 
 		 319 aa  170  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  40.19 
 
 		 359 aa  169  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  39.13 
 
 		 294 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0718  protein of unknown function DUF344  43.01 
 
 		 260 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15403  normal  0.613775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  36.64 
 
 		 288 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  39.55 
 
 		 294 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  41.07 
 
 		 314 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  38.57 
 
 		 289 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  39.64 
 
 		 300 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  37.67 
 
 		 365 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  32.63 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  34.82 
 
 		 293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  35.92 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  35.92 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  39.25 
 
 		 284 aa  167  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  39.91 
 
 		 324 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  41.45 
 
 		 405 aa  167  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>