More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3557 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  99.34 
 
 		 452 aa  926    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  72.36 
 
 		 457 aa  681    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  84.77 
 
 		 453 aa  802    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  78.98 
 
 		 455 aa  772    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  84.99 
 
 		 453 aa  803    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  79.33 
 
 		 455 aa  748    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  79.91 
 
 		 454 aa  775    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  82.12 
 
 		 454 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  100 
 
 		 452 aa  931    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  96.9 
 
 		 452 aa  911    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  84.99 
 
 		 453 aa  801    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  84.11 
 
 		 453 aa  803    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  74.78 
 
 		 456 aa  718    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  79.15 
 
 		 457 aa  744    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  74.78 
 
 		 456 aa  718    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  63.3 
 
 		 466 aa  608  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  63.41 
 
 		 451 aa  589  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  62.86 
 
 		 460 aa  585  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  59.38 
 
 		 459 aa  555  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  58.8 
 
 		 478 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  60.59 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  57.98 
 
 		 482 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  57.33 
 
 		 464 aa  541  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  58.43 
 
 		 481 aa  544  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  57.59 
 
 		 478 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  57.74 
 
 		 470 aa  538  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  57.11 
 
 		 471 aa  533  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  56.98 
 
 		 465 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  57.75 
 
 		 480 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  56.76 
 
 		 477 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  55.41 
 
 		 461 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  55.75 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  57.21 
 
 		 475 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  55.19 
 
 		 461 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  57.21 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  56.24 
 
 		 472 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  56.24 
 
 		 472 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  57.75 
 
 		 480 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  57.53 
 
 		 480 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  57.53 
 
 		 480 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  56.24 
 
 		 472 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  54.04 
 
 		 460 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  56.01 
 
 		 475 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  56.01 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  54.88 
 
 		 461 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  56.01 
 
 		 477 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  56.01 
 
 		 476 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  55.1 
 
 		 464 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  56.01 
 
 		 475 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  55.1 
 
 		 464 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  55.25 
 
 		 455 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  57.71 
 
 		 478 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  53.41 
 
 		 456 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  54.08 
 
 		 458 aa  500  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  53.65 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  56.4 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  52.14 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  51.47 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  52.23 
 
 		 460 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  51.02 
 
 		 460 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  52.01 
 
 		 460 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  52.02 
 
 		 456 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  52.01 
 
 		 460 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  55.46 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  52.53 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  50 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  42.69 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  43.32 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  41.14 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  42.11 
 
 		 458 aa  363  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  42.27 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  42.95 
 
 		 460 aa  358  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  40.85 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  41.04 
 
 		 456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  43.22 
 
 		 463 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  42.99 
 
 		 485 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  40.82 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  41.14 
 
 		 460 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  41.59 
 
 		 463 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  41.59 
 
 		 460 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  41.36 
 
 		 456 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  42.96 
 
 		 455 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  41.43 
 
 		 468 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  41.58 
 
 		 468 aa  345  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  42.34 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  40.98 
 
 		 451 aa  343  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  38.14 
 
 		 467 aa  340  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  43.19 
 
 		 465 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  41.57 
 
 		 461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  42.99 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  39.24 
 
 		 465 aa  339  5e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  42.4 
 
 		 462 aa  339  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  40.23 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  42.33 
 
 		 452 aa  335  7.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.32 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  42.99 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  38.32 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  40.4 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  41.78 
 
 		 466 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  40.45 
 
 		 468 aa  332  8e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>