More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3346 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
284 aa  589  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1128  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase/reductase  54.77 
 
 
287 aa  321  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.41 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.07 
 
 
285 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.55 
 
 
281 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1426  hypothetical protein  43.42 
 
 
282 aa  233  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0301389  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.06 
 
 
284 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4463  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
285 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 
315 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0360339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0633  epimerase protein  30.63 
 
 
290 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3072  UDP-glucose 4-epimerase  28.62 
 
 
307 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3376  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  27.21 
 
 
307 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3402  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  27.94 
 
 
307 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3398  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.84 
 
 
307 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.4 
 
 
307 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0139899  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
292 aa  99  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000135991  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0596  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
346 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
302 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0679369  normal  0.411076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
298 aa  89.7  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0418863  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.388725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
326 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
326 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
302 aa  85.5  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179855  normal  0.339449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  24.67 
 
 
327 aa  79  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
309 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1869  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0242314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.94 
 
 
336 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  28.57 
 
 
336 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.74 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18870  UDP-galactose 4-epimerase  26.8 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
408 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.91 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  23.7 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  28.52 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  25.53 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  25.64 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.4 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.2 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  23.28 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  23.28 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  24.44 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  26.12 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  26.8 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4642  predicted protein  25.83 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.609905  normal  0.210663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  25.18 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  26.09 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  26.23 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  24.1 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0386  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  26.16 
 
 
410 aa  72.4  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  23.51 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.49 
 
 
333 aa  72  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07621  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.17 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  22.62 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  24.34 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  24.16 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  25.09 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  25.41 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  25.09 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  26.25 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  24.51 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  24.84 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>