47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2849 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 489 aa  996    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  50.32 
 
 		 518 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3181  Fibronectin type III domain protein  48.26 
 
 		 524 aa  123  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  47.97 
 
 		 1024 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  41.6 
 
 		 1482 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  63.38 
 
 		 873 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  51.11 
 
 		 1314 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  44.8 
 
 		 1189 aa  81.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  59.46 
 
 		 717 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  54.29 
 
 		 679 aa  78.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  51.39 
 
 		 2082 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  40.66 
 
 		 1814 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  35.34 
 
 		 646 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  34.74 
 
 		 1017 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  37 
 
 		 892 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  50 
 
 		 1067 aa  66.6  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3967  fibronectin, type III domain-containing protein  36.11 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.476574  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  46.05 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  40.51 
 
 		 1236 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2024  hypothetical protein  45.45 
 
 		 101 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  37.31 
 
 		 675 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0952  fibronectin, type III domain-containing protein  34.21 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  41.24 
 
 		 1047 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  34.56 
 
 		 722 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  38.2 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  43.66 
 
 		 724 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0446  fibronectin type III domain-containing protein  38.27 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00035766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.44 
 
 		 607 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 		 1184 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  33.78 
 
 		 1321 aa  54.3  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  36.45 
 
 		 1141 aa  53.5  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  33.64 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  37.66 
 
 		 3802 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0465  fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 505 aa  51.2  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.271511  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  33.04 
 
 		 725 aa  50.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1406 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  42.05 
 
 		 527 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  45.1 
 
 		 864 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0196  fibronectin, type III  35.14 
 
 		 354 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2032  hypothetical protein  28.76 
 
 		 2004 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1601 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  34.92 
 
 		 827 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.53 
 
 		 6885 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  32.58 
 
 		 885 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3268  hypothetical protein  40.74 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  40.35 
 
 		 1219 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  34.21 
 
 		 1096 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>